More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0502 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  88.45 
 
 		 433 aa  793    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 433 aa  888    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  88.45 
 
 		 433 aa  795    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1937  DNA gyrase modulator peptidase U62  34.81 
 
 		 437 aa  249  9e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.227653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.43 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.78 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.25 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.26 
 
 		 437 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5204  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.17 
 
 		 427 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000020169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.73 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4727  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.39 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1589  putative modulator of DNA gyrase  33.11 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.880571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2161  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.84 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.54 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.02 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.66 
 
 		 450 aa  166  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.46 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0779  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase  27.79 
 
 		 430 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0996671  unclonable  0.000000000000263997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  28.1 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.91 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.35 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.86 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.03 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.44 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0773  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.57 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0050  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.8 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.33 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.85 
 
 		 425 aa  146  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.46 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.29 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.84 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.03 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.29 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1493  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.47 
 
 		 420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.33 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 		 462 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  26.89 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.67 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  26.67 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.03 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0838  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.11 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.96 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.83 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  25.82 
 
 		 467 aa  126  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  25.77 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  27.25 
 
 		 446 aa  123  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.94 
 
 		 435 aa  122  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  31.62 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.94 
 
 		 435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.12 
 
 		 464 aa  119  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  37.88 
 
 		 460 aa  119  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  27.53 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.67 
 
 		 443 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0719088  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29 
 
 		 453 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.88 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.95 
 
 		 465 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.28 
 
 		 475 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.12 
 
 		 465 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  24.34 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  27.48 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4592  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.68 
 
 		 475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.24 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.66 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.1 
 
 		 483 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0549  pmbA protein  27.42 
 
 		 457 aa  113  9e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.86 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.37 
 
 		 475 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2687  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.62 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  27.6 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  25.61 
 
 		 475 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.14 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0812  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.61 
 
 		 475 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2236  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.73 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0328346 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.03 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0893  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.2 
 
 		 475 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  31.11 
 
 		 460 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  33.16 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  33.51 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  26.47 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.98 
 
 		 447 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  23.77 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1036  TldD  25.75 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.61 
 
 		 443 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.9 
 
 		 476 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.75 
 
 		 468 aa  103  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 		 460 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 		 460 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  26.13 
 
 		 473 aa  103  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.07 
 
 		 470 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.69 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.02 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.64 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.78 
 
 		 437 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0403  TldD/PmbA family protein  26.08 
 
 		 472 aa  100  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.65 
 
 		 470 aa  99.8  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.74 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.79 
 
 		 486 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  32.68 
 
 		 480 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.73 
 
 		 448 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.58 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>