More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0370 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  96.52 
 
 
608 aa  1190    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.81 
 
 
656 aa  662    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.4 
 
 
651 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.15 
 
 
615 aa  635    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
604 aa  1223    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.33 
 
 
643 aa  743    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  97.19 
 
 
499 aa  985    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.69 
 
 
640 aa  658    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.33 
 
 
602 aa  640    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.53 
 
 
638 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.62 
 
 
639 aa  646    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  52.82 
 
 
637 aa  629  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.28 
 
 
607 aa  630  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.32 
 
 
653 aa  625  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.91 
 
 
639 aa  618  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  56.18 
 
 
656 aa  621  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  52.07 
 
 
616 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.64 
 
 
611 aa  621  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.59 
 
 
657 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  51.17 
 
 
614 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.73 
 
 
632 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.91 
 
 
635 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  53.54 
 
 
654 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  50.33 
 
 
608 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.36 
 
 
685 aa  609  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.25 
 
 
620 aa  610  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  52.09 
 
 
627 aa  608  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 
676 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.7 
 
 
652 aa  609  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.24 
 
 
633 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  51.91 
 
 
633 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  51.74 
 
 
633 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  51.74 
 
 
633 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  51.74 
 
 
633 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  52.07 
 
 
633 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  51.74 
 
 
633 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.64 
 
 
630 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  51.74 
 
 
633 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  51.74 
 
 
633 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  51.74 
 
 
633 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.75 
 
 
672 aa  605  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.38 
 
 
608 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  51.9 
 
 
693 aa  602  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  51.24 
 
 
682 aa  601  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.36 
 
 
759 aa  600  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  50.08 
 
 
665 aa  601  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.33 
 
 
679 aa  601  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.34 
 
 
621 aa  599  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.21 
 
 
753 aa  597  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.83 
 
 
630 aa  595  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.67 
 
 
651 aa  597  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.16 
 
 
599 aa  597  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.92 
 
 
673 aa  597  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.54 
 
 
682 aa  595  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 
612 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.87 
 
 
614 aa  593  1e-168  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
612 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.33 
 
 
637 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  61.05 
 
 
753 aa  592  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 
630 aa  595  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  49.34 
 
 
700 aa  591  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.79 
 
 
619 aa  589  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  50.81 
 
 
662 aa  590  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.67 
 
 
697 aa  588  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  51.83 
 
 
645 aa  589  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
636 aa  588  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.47 
 
 
672 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.34 
 
 
645 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.18 
 
 
610 aa  588  1e-167  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.67 
 
 
697 aa  588  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.42 
 
 
656 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.01 
 
 
617 aa  587  1e-166  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.51 
 
 
659 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.85 
 
 
610 aa  586  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  50.42 
 
 
635 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.42 
 
 
635 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 
617 aa  588  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.75 
 
 
743 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  49.75 
 
 
639 aa  587  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.42 
 
 
635 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.04 
 
 
660 aa  585  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  49.01 
 
 
764 aa  585  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  48.49 
 
 
638 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  48.61 
 
 
681 aa  583  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.49 
 
 
652 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.66 
 
 
637 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.33 
 
 
640 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.07 
 
 
798 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
669 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 
601 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 
645 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.09 
 
 
647 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 
645 aa  579  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.26 
 
 
635 aa  580  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.77 
 
 
684 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.9 
 
 
616 aa  580  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.88 
 
 
783 aa  579  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.53 
 
 
659 aa  578  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.34 
 
 
601 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.1 
 
 
669 aa  578  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>