More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1820 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1820  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 315 aa  627  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  32.56 
 
 		 242 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  42.07 
 
 		 235 aa  94  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 233 aa  86.3  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.45 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1806  hypothetical protein  38.41 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.727626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.19 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3273  Methyltransferase type 12  23.17 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 233 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.04 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  43.69 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  38.66 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0692  Methyltransferase type 11  37.69 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283782  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0691  Methyltransferase type 11  37.69 
 
 		 205 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484413  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1437  methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00131296  decreased coverage  0.0000500722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  36.57 
 
 		 1014 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.21 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.62 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.29 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  34.71 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  37.58 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.91 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0657  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  34.9 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  35.86 
 
 		 776 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  33.61 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.25 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.43 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.59 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 247 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  32.2 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.69 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.69 
 
 		 277 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.47 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 261 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.04 
 
 		 345 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0952  methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  33.33 
 
 		 265 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.05 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 215 aa  53.9  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  29.55 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3036  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.48 
 
 		 229 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.31 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  37.93 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 267 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>