More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1606 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  37.5 
 
 		 489 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  40.7 
 
 		 831 aa  109  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0510  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 277 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  39.35 
 
 		 368 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  40.88 
 
 		 684 aa  104  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.75 
 
 		 343 aa  104  9e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  41.89 
 
 		 557 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  39.74 
 
 		 393 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  36.13 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.67 
 
 		 528 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  37.57 
 
 		 789 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  38.36 
 
 		 961 aa  99.4  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  37.82 
 
 		 373 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  39.61 
 
 		 1402 aa  98.2  8e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.83 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.94 
 
 		 241 aa  97.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  33.77 
 
 		 359 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  41.61 
 
 		 685 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.88 
 
 		 376 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  37.18 
 
 		 373 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35.59 
 
 		 425 aa  97.1  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  40.56 
 
 		 839 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.29 
 
 		 376 aa  95.9  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.97 
 
 		 278 aa  95.9  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.26 
 
 		 1012 aa  95.5  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  33.5 
 
 		 271 aa  94.4  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  35.39 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  41.06 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1493 aa  93.2  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.11 
 
 		 380 aa  92.4  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.86 
 
 		 2413 aa  91.7  8e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  37.32 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  36.77 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  35.62 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  36.88 
 
 		 838 aa  90.5  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  35.19 
 
 		 1037 aa  90.9  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 303 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  34.36 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  41.1 
 
 		 193 aa  89.4  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  39.6 
 
 		 416 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  40.88 
 
 		 448 aa  88.6  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  33.14 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.49 
 
 		 363 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 1032 aa  86.7  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 		 252 aa  86.3  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.5 
 
 		 798 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.98 
 
 		 341 aa  85.5  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3011  Sel1-like  47.78 
 
 		 165 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.98 
 
 		 392 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.2 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3379  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.95 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.287446  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 		 976 aa  84.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  36.88 
 
 		 1002 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.25 
 
 		 1110 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.99 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2868  Sel1 domain-containing protein  32.58 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215406  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 505 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.08 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0657  Sel1 domain-containing protein  35.19 
 
 		 439 aa  81.6  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.76 
 
 		 318 aa  81.6  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.85 
 
 		 490 aa  81.6  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3443  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.29 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  35.53 
 
 		 482 aa  81.6  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.24 
 
 		 321 aa  81.6  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  30.93 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.62 
 
 		 731 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  36.24 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36.13 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  40.41 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.81 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  35.44 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  34.97 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  29.76 
 
 		 839 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  33.9 
 
 		 315 aa  78.6  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  42.59 
 
 		 337 aa  78.6  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  35.57 
 
 		 348 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  33.52 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  38.41 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  37.23 
 
 		 679 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  34.21 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  33.77 
 
 		 850 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.76 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  34.87 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  32.53 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  33.91 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  33.52 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  30.06 
 
 		 971 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.9 
 
 		 865 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 		 1430 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  33.99 
 
 		 763 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  39.55 
 
 		 464 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  37.14 
 
 		 1105 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.99 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  37.14 
 
 		 680 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  37.84 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>