More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1402 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1402  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
392 aa  806    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3016  glycosyl transferase group 1  55.5 
 
 
373 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  47.7 
 
 
367 aa  322  6e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
399 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.4 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  39.15 
 
 
389 aa  97.4  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
401 aa  95.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
384 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 
391 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  35.41 
 
 
402 aa  93.2  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
387 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 
360 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.96 
 
 
388 aa  90.1  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.51 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
419 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
409 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  33.17 
 
 
371 aa  87.4  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
377 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  39.08 
 
 
453 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  33.14 
 
 
379 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  37.57 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.21 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
385 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
385 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
371 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
368 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.46 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  28.91 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
739 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.74 
 
 
745 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.95 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
384 aa  79.3  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.39 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  39.33 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
372 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.95 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  36.21 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  30.98 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  34.02 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
400 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  28.11 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.42 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4202  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.42 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  28.64 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.55 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.93 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  39.1 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 
345 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  37.75 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  36.89 
 
 
384 aa  77  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.52 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.94 
 
 
745 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  27.41 
 
 
350 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  29.52 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>