65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2098 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 
204 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  67.49 
 
 
203 aa  264  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  46.91 
 
 
209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  44.85 
 
 
208 aa  181  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  46.39 
 
 
205 aa  179  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  45.08 
 
 
206 aa  171  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  43.41 
 
 
206 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  38.54 
 
 
198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  39.18 
 
 
200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  39.18 
 
 
200 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  39.9 
 
 
200 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  39.9 
 
 
200 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  38.34 
 
 
200 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  38.89 
 
 
193 aa  131  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  37.78 
 
 
194 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  37.43 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  37.43 
 
 
194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  37.78 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  36.67 
 
 
191 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  36.67 
 
 
191 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  33.33 
 
 
190 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  36.11 
 
 
191 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  36.11 
 
 
191 aa  121  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  35.11 
 
 
189 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  36.31 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  34.9 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  34.9 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  36.51 
 
 
247 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  32.98 
 
 
189 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  32.67 
 
 
218 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  32.97 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  32.82 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  38.52 
 
 
138 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  30.57 
 
 
197 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  32.8 
 
 
188 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  29.49 
 
 
293 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  39.33 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  57.14 
 
 
88 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  56.36 
 
 
89 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  42.05 
 
 
170 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  50.94 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  54.55 
 
 
89 aa  55.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  47.14 
 
 
135 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  50.79 
 
 
189 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  40 
 
 
171 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  44.44 
 
 
191 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  49.09 
 
 
184 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  31.13 
 
 
114 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  32.76 
 
 
442 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  31.9 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  42.86 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  55.26 
 
 
47 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  44.23 
 
 
142 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01356  hypothetical protein  61.11 
 
 
36 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  40.3 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  26.73 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0627  hypothetical protein  43.1 
 
 
116 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  34.67 
 
 
139 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1332  tail fiber assembly protein from lambdoid prophage e14  23.78 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  34.67 
 
 
138 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 
145 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  30.43 
 
 
253 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  54.35 
 
 
82 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  31.82 
 
 
212 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>