277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2348 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  100 
 
 
382 aa  736    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  79.06 
 
 
396 aa  570  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  76.96 
 
 
384 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  75.46 
 
 
384 aa  541  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  69.82 
 
 
381 aa  498  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  67.54 
 
 
382 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  67.28 
 
 
382 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  64.4 
 
 
382 aa  478  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  64.4 
 
 
382 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.707303 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  64.14 
 
 
382 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  64.14 
 
 
382 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  64.14 
 
 
382 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  65.45 
 
 
382 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  64.14 
 
 
382 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  64.14 
 
 
382 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  65.45 
 
 
382 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  64.4 
 
 
382 aa  477  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  65.45 
 
 
382 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  65.97 
 
 
382 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  65.18 
 
 
382 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  65.18 
 
 
382 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  51.3 
 
 
384 aa  357  9.999999999999999e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  33.96 
 
 
386 aa  163  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  33.87 
 
 
389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05696  hypothetical protein  32.3 
 
 
356 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  33.42 
 
 
384 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  35.33 
 
 
431 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  30.73 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  35.61 
 
 
430 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  35.33 
 
 
432 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 
454 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  32.77 
 
 
409 aa  144  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  30.83 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  31.48 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  33.43 
 
 
412 aa  139  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  29.89 
 
 
520 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  29.36 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  31.28 
 
 
444 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  35.16 
 
 
436 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3634  major facilitator transporter  30.32 
 
 
389 aa  135  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  31.65 
 
 
452 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  30.54 
 
 
444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000082  permease  31.09 
 
 
386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0172441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  30.54 
 
 
446 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4031  major facilitator transporter  31.99 
 
 
388 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3835  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 
388 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3908  major facilitator transporter  31.99 
 
 
388 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0425  major facilitator transporter  32.28 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  31.64 
 
 
465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  29.23 
 
 
447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  30.08 
 
 
459 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  32.23 
 
 
446 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  27.95 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  30.08 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  30.38 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  31.37 
 
 
473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  29.89 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  29.89 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  29.73 
 
 
443 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  29.73 
 
 
481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  30.03 
 
 
480 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  30.03 
 
 
480 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 
480 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  30.27 
 
 
480 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  28.57 
 
 
476 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  31.49 
 
 
436 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  28.65 
 
 
476 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  30.37 
 
 
471 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  28.84 
 
 
474 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3394  major facilitator transporter  32.75 
 
 
388 aa  123  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  26.63 
 
 
428 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  28.3 
 
 
474 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  31.64 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  31.49 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
417 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  32.07 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  27.5 
 
 
412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 
430 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  32.06 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  26.53 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  27.11 
 
 
395 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  31.76 
 
 
438 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  28.88 
 
 
464 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  27.22 
 
 
412 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  27.11 
 
 
395 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  28.39 
 
 
412 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  28.53 
 
 
446 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  27.64 
 
 
446 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  27.64 
 
 
446 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  29.39 
 
 
412 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  26.34 
 
 
395 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  23.1 
 
 
398 aa  104  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  30.72 
 
 
447 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  25.62 
 
 
418 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3989  major facilitator transporter  26.24 
 
 
410 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  26.88 
 
 
418 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  26.88 
 
 
418 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  26.15 
 
 
421 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  29.71 
 
 
443 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>