More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2369 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  502  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  78.24 
 
 
249 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  76.67 
 
 
244 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  78.66 
 
 
244 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  66.67 
 
 
242 aa  342  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  65.83 
 
 
240 aa  336  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  65 
 
 
244 aa  329  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  64.58 
 
 
240 aa  328  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  62.66 
 
 
242 aa  323  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  61.25 
 
 
242 aa  323  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1091  ABC transporter related  70.54 
 
 
242 aa  322  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.589551  normal  0.0194834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  64.58 
 
 
239 aa  322  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  62.5 
 
 
240 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  61.67 
 
 
240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  62.76 
 
 
246 aa  319  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  64.58 
 
 
243 aa  318  5e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  62.08 
 
 
240 aa  317  7.999999999999999e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  61.67 
 
 
240 aa  317  9e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  64.17 
 
 
243 aa  315  3e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  64.58 
 
 
252 aa  315  3e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 
240 aa  315  4e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  64.17 
 
 
243 aa  315  4e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  61.67 
 
 
240 aa  315  6e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  62.5 
 
 
248 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  61.92 
 
 
247 aa  313  9.999999999999999e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  62.4 
 
 
243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  60 
 
 
247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  62.5 
 
 
240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  62.08 
 
 
240 aa  312  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  61 
 
 
243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  62.5 
 
 
255 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  61.25 
 
 
242 aa  311  4.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  61 
 
 
242 aa  311  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  61.25 
 
 
243 aa  311  7.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  60.49 
 
 
243 aa  310  9e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  61.67 
 
 
240 aa  310  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  62.08 
 
 
244 aa  310  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  62.08 
 
 
247 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  62.08 
 
 
240 aa  310  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.09 
 
 
247 aa  310  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  61.41 
 
 
242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  60.83 
 
 
240 aa  308  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  60.83 
 
 
240 aa  308  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  62.14 
 
 
243 aa  308  5e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.83 
 
 
246 aa  308  5e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  60.83 
 
 
246 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.08 
 
 
251 aa  308  5.9999999999999995e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  60.17 
 
 
243 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  59.83 
 
 
246 aa  308  6.999999999999999e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.92 
 
 
240 aa  307  9e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  62.5 
 
 
243 aa  307  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  59 
 
 
257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  62.08 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  60.17 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  59.41 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  60.67 
 
 
240 aa  305  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 
240 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 
269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  61.51 
 
 
249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60 
 
 
244 aa  305  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  305  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  305  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  305  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  61.09 
 
 
248 aa  305  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  61.67 
 
 
240 aa  305  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.25 
 
 
244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 
240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  60 
 
 
243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  62.66 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.83 
 
 
247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  58.75 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  59.58 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  61.25 
 
 
278 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 
284 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  59 
 
 
269 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  60 
 
 
242 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  61.32 
 
 
243 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  60.42 
 
 
246 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  61.09 
 
 
257 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
240 aa  301  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
253 aa  301  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  62.08 
 
 
243 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  60.67 
 
 
240 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  60.67 
 
 
240 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  58.75 
 
 
241 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60.42 
 
 
242 aa  300  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  60.67 
 
 
240 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  60.67 
 
 
240 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  60.83 
 
 
253 aa  300  1e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  58.75 
 
 
241 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  60.67 
 
 
240 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  60 
 
 
242 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  60.25 
 
 
246 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>