55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1270 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1270  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 320 aa  668    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511064  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0244  Radical SAM domain protein  21.94 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0305821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0586  radical SAM family protein  31.54 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  22.18 
 
 		 446 aa  59.3  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0506  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  23.64 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  26.99 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  21.65 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  22.58 
 
 		 418 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  20.91 
 
 		 415 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  18.49 
 
 		 501 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 397 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0182  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 334 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.505974  normal  0.796487 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 394 aa  49.3  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 		 358 aa  49.3  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  21.11 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  19.26 
 
 		 390 aa  49.3  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  21.68 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1807  radical SAM domain-containing protein  19.88 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  23.7 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2586  radical SAM domain-containing protein  21.64 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  22.18 
 
 		 384 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  21.96 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  22.54 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.36 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  22.93 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  20.77 
 
 		 380 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  20.49 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  22.98 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  22.5 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 		 565 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 		 468 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  21.16 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  23.6 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0881  radical SAM family Fe-S protein  22.14 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.730435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  19.71 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  20.12 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  23.21 
 
 		 459 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  20.96 
 
 		 358 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  22.06 
 
 		 482 aa  43.5  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  20.08 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  20.96 
 
 		 358 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0509  radical SAM domain-containing protein  20.86 
 
 		 359 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294869  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  21.95 
 
 		 491 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.49 
 
 		 480 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  22.09 
 
 		 422 aa  43.1  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  21.66 
 
 		 393 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  22.29 
 
 		 394 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 1000 aa  42.7  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>