More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0642 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0642  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 390 aa  774    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1491  protein of unknown function UPF0118  25.47 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.961051  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0130  hypothetical protein  34.78 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1483  hypothetical protein  28.31 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1797  hypothetical protein  39.13 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3416  hypothetical protein  27.95 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602255 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1740  hypothetical protein  37.2 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1926  hypothetical protein  37.2 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1958  hypothetical protein  37.2 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000222767 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0039  permease  25.97 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2006  hypothetical protein  37.2 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.277817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5570  hypothetical protein  34.78 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1783  hypothetical protein  37.2 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5291  hypothetical protein  34.78 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1762  hypothetical protein  37.2 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0301209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5118  membrane protein  34.78 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5133  membrane protein  34.78 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000220099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5533  hypothetical protein  34.78 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1922  hypothetical protein  37.2 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5688  hypothetical protein  34.78 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2027  hypothetical protein  37.2 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0291717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5618  hypothetical protein  34.78 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3955  hypothetical protein  34.16 
 
 		 347 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5562  membrane protein YdbI  34.16 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5231  hypothetical protein  31.22 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5387  hypothetical protein  34.16 
 
 		 314 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.514486  normal  0.849251 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3344  protein of unknown function UPF0118  24.56 
 
 		 343 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395635  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 		 412 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1793  permease  24.78 
 
 		 331 aa  87  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384748  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  29.96 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  27.84 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  24.94 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  23.96 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  24.86 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  24.86 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  24.86 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  24.86 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  24.86 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  25.07 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  25.07 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  25.07 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  25.07 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  25.07 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  25.07 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  25.07 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  25.07 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.36 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  23.51 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  25 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  20.89 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  28.7 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.72 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  27.34 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  29.58 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  29.58 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  31.32 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  24.38 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0313  permease  28.02 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  26.56 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  26.56 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  30.49 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  27.01 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  31.4 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  24.54 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  31.58 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  26.02 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  22.85 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  30.13 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  25.22 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  31.47 
 
 		 476 aa  67  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3538  hypothetical protein  27.48 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.25155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  22.47 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  24.07 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  24.01 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  25.07 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  28.02 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  30.14 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  25.4 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  24.53 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  34.03 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  24.36 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  27.71 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 650 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  20.44 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  28.68 
 
 		 475 aa  63.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  24.61 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  23.36 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  29 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  21.79 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  25.32 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  27.01 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  25.45 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  24.61 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  24.33 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  24.5 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  25.86 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.22 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>