84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1245 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1245  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  261  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00148466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  31.78 
 
 		 554 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  36.17 
 
 		 540 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  29.91 
 
 		 552 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6785  resolvase domain-containing protein  42.11 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6782  resolvase domain-containing protein  42.11 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  31 
 
 		 569 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  30.11 
 
 		 534 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  34.09 
 
 		 743 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  32.69 
 
 		 546 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  28.87 
 
 		 475 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  30.25 
 
 		 299 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  31.73 
 
 		 558 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  34 
 
 		 532 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  29.17 
 
 		 336 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  29.17 
 
 		 462 aa  48.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  29.25 
 
 		 563 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  36.47 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 542 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  36.47 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  36.47 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 542 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  31.25 
 
 		 576 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  31.13 
 
 		 546 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  28 
 
 		 505 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  38.3 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  31.18 
 
 		 584 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  31.03 
 
 		 545 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  32.18 
 
 		 542 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  36.51 
 
 		 441 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  30.68 
 
 		 544 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.82 
 
 		 274 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  25.56 
 
 		 500 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  28.16 
 
 		 482 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  37.23 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 568 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  28 
 
 		 578 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  32.71 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  31.96 
 
 		 515 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  36.51 
 
 		 443 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  33.33 
 
 		 528 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0557  resolvase-like protein  29.81 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158765  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  33.33 
 
 		 528 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  28.92 
 
 		 462 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  36.79 
 
 		 231 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2170  DNA invertase  36.67 
 
 		 281 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0593579  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  28.92 
 
 		 462 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  34.92 
 
 		 522 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  27.71 
 
 		 343 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  31.18 
 
 		 515 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  31.76 
 
 		 564 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  28.3 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0381  resolvase domain-containing protein  32.94 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0368407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  29.41 
 
 		 738 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.55 
 
 		 485 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  24.27 
 
 		 494 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  31.37 
 
 		 562 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  37.37 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11450  Resolvase domain protein  28.79 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000780792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  29.03 
 
 		 551 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4608  DNA recombinase, putative  26.74 
 
 		 511 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  37.37 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  23 
 
 		 502 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.78 
 
 		 506 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  29.03 
 
 		 662 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  32.93 
 
 		 564 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  36.84 
 
 		 196 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  36.84 
 
 		 449 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  25.25 
 
 		 474 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  32.41 
 
 		 524 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  37.89 
 
 		 196 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 189 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  32.22 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  36.99 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.09 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  33.68 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  27.64 
 
 		 488 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  30.86 
 
 		 445 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 		 441 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2222  putative site-specific recombinase, resolvase family  27.27 
 
 		 261 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61199e-51 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  27.71 
 
 		 460 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  27.59 
 
 		 539 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 		 200 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>