68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2165 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  965    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  36.39 
 
 		 539 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  30.23 
 
 		 802 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  38.36 
 
 		 308 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  34.41 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  37.91 
 
 		 720 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  35.59 
 
 		 800 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  33.48 
 
 		 740 aa  120  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  26.45 
 
 		 577 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  26.45 
 
 		 577 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  26.45 
 
 		 577 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  27.38 
 
 		 791 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  26.37 
 
 		 733 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  30.14 
 
 		 768 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  27.35 
 
 		 815 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  27.63 
 
 		 726 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  41.95 
 
 		 769 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  41.95 
 
 		 769 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  41.95 
 
 		 802 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  41.95 
 
 		 802 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  28.46 
 
 		 882 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2919  hypothetical protein  29.81 
 
 		 764 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  30.35 
 
 		 753 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  30.35 
 
 		 753 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0415  hypothetical protein  31.34 
 
 		 764 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.762934 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  26.73 
 
 		 670 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  29.25 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  28.72 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  28.97 
 
 		 969 aa  77.4  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  26.44 
 
 		 698 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  27.68 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  26.25 
 
 		 1118 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  27.36 
 
 		 686 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  27.62 
 
 		 963 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  25.75 
 
 		 1338 aa  70.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  27.62 
 
 		 960 aa  67  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  31.41 
 
 		 675 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  27.68 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  26.33 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  23.53 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  28.49 
 
 		 1892 aa  63.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02032  hypothetical protein  35.71 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  26.3 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  25.82 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  25.46 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  26.72 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  22.45 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  25.15 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  25.1 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  29.73 
 
 		 345 aa  53.5  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  26.77 
 
 		 341 aa  53.5  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  25.33 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  25.64 
 
 		 453 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  28.65 
 
 		 344 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  28.65 
 
 		 344 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  28.65 
 
 		 344 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  27.53 
 
 		 514 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  26.28 
 
 		 523 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  28.11 
 
 		 344 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  28.9 
 
 		 345 aa  47  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  32.28 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  28.84 
 
 		 345 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  26.49 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  27.06 
 
 		 345 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  23.43 
 
 		 345 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  27.06 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  27.54 
 
 		 530 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>