More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5443 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  673    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  61.13 
 
 		 327 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  58.75 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  54.12 
 
 		 328 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  54.12 
 
 		 328 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  54.67 
 
 		 334 aa  338  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  46.31 
 
 		 334 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  48.68 
 
 		 366 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  44.12 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.89 
 
 		 328 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  46.33 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  42.31 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.76 
 
 		 331 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.95 
 
 		 304 aa  275  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.95 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.36 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.94 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.43 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.43 
 
 		 325 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.33 
 
 		 323 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.18 
 
 		 331 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.95 
 
 		 325 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.52 
 
 		 327 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  44.97 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.29 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.28 
 
 		 333 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.59 
 
 		 330 aa  265  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 		 330 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.59 
 
 		 330 aa  265  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  44.15 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  45.67 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.96 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  41.49 
 
 		 331 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.54 
 
 		 349 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.49 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.08 
 
 		 328 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.52 
 
 		 335 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.08 
 
 		 328 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  45.14 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.61 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.07 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.31 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.58 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.68 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.62 
 
 		 331 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  42.52 
 
 		 325 aa  259  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  44.67 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.26 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.88 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.6 
 
 		 336 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.02 
 
 		 325 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.08 
 
 		 335 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  41.12 
 
 		 322 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  40.84 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40.3 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  42.28 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.33 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.05 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.33 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.43 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  40.87 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.53 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.36 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  39.61 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  39.07 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.9 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.96 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  40.12 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  41.53 
 
 		 318 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  43.29 
 
 		 321 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.64 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  42.28 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.28 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  42.19 
 
 		 329 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  42.18 
 
 		 335 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.43 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.28 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  42.14 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.27 
 
 		 338 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.14 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  41.37 
 
 		 356 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.97 
 
 		 345 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  41.61 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.36 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.8 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.32 
 
 		 332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.97 
 
 		 345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  41.1 
 
 		 338 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.2 
 
 		 329 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.67 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  42.05 
 
 		 348 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  36.99 
 
 		 328 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  40.24 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.53 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  41.69 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.98 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  42.42 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  41.69 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>