More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4549 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
289 aa  581  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  57.62 
 
 
234 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  55.17 
 
 
216 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  53 
 
 
203 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  51.47 
 
 
211 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  51.47 
 
 
211 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  51 
 
 
203 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  48.73 
 
 
228 aa  198  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  50 
 
 
203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  42.73 
 
 
231 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  41.78 
 
 
231 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  41.78 
 
 
231 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  43.07 
 
 
231 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  48.83 
 
 
244 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  41.5 
 
 
218 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  42.08 
 
 
207 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  37.64 
 
 
187 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  37.64 
 
 
187 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 
198 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  35.96 
 
 
181 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 
181 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
181 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  35.39 
 
 
181 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  36.6 
 
 
223 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  35.39 
 
 
187 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  35.39 
 
 
187 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  35.39 
 
 
187 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  35.39 
 
 
187 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  35.39 
 
 
187 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  35.9 
 
 
200 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  36.98 
 
 
198 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  40.94 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  37.5 
 
 
198 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
186 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  36.41 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  37.84 
 
 
221 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 
182 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  37.84 
 
 
221 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  38.98 
 
 
240 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  40.23 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  32.95 
 
 
185 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 
201 aa  106  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 
184 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  38.51 
 
 
221 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  38.62 
 
 
199 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 
199 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 
199 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  35.16 
 
 
184 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  33.52 
 
 
184 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 
193 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  34.04 
 
 
185 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  35.87 
 
 
210 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 
201 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 
201 aa  102  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 
187 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  35.56 
 
 
184 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 
190 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  34.07 
 
 
184 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  34.07 
 
 
184 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  34.07 
 
 
184 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 
181 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
193 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  39.44 
 
 
182 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  32.45 
 
 
185 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  38.98 
 
 
210 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 
196 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 
181 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 
199 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 
199 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 
199 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 
184 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  35.23 
 
 
181 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 
212 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
199 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  39.15 
 
 
198 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  39.08 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 
187 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 
185 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  32 
 
 
196 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  31.46 
 
 
180 aa  93.6  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  31.43 
 
 
196 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  35 
 
 
211 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 
196 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
182 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  34.24 
 
 
209 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  35.16 
 
 
197 aa  92.4  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  37.29 
 
 
182 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 
185 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 
196 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 
187 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
196 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  35.91 
 
 
193 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  36.53 
 
 
199 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  35.39 
 
 
209 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 
209 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  35.16 
 
 
185 aa  89  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  35.97 
 
 
313 aa  89  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  37.08 
 
 
182 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 
196 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 
219 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>