More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3895 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3895  major facilitator transporter  100 
 
 
483 aa  921    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373107  hitchhiker  0.00809284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  59.18 
 
 
445 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  48.48 
 
 
462 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26390  arabinose efflux permease family protein  45.39 
 
 
495 aa  290  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  44.87 
 
 
461 aa  287  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0739  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 
504 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184033  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  43.01 
 
 
489 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3774  major facilitator transporter  46.97 
 
 
465 aa  269  7e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 
498 aa  260  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  38.56 
 
 
462 aa  260  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  45.59 
 
 
464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  43.42 
 
 
515 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  40.45 
 
 
469 aa  237  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  39.1 
 
 
461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  43.5 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 
452 aa  210  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3939  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 
465 aa  207  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116564  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  38.62 
 
 
462 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  31.81 
 
 
468 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20420  arabinose efflux permease family protein  36.62 
 
 
492 aa  159  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 
506 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
497 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  26.57 
 
 
500 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.84 
 
 
517 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  30.65 
 
 
490 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  32.11 
 
 
486 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 
489 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  28.91 
 
 
487 aa  96.3  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 
449 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
548 aa  93.2  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 
491 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 
491 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 
448 aa  90.1  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.88 
 
 
678 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.42 
 
 
489 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  38.85 
 
 
481 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.5 
 
 
491 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  32.67 
 
 
492 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 
484 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.65 
 
 
565 aa  87.8  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.23 
 
 
476 aa  87.8  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 
496 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.53 
 
 
495 aa  86.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  29.29 
 
 
484 aa  85.9  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.13 
 
 
495 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.08 
 
 
495 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.57 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.94 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.14 
 
 
555 aa  84  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.53 
 
 
480 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 
496 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.94 
 
 
501 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3297  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
477 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.78 
 
 
531 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.99 
 
 
528 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 
478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.71 
 
 
479 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1223  major facilitator transporter  31.64 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.1 
 
 
519 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  29.17 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.61 
 
 
650 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  24.71 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.64 
 
 
697 aa  80.9  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 
491 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  24.71 
 
 
478 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.71 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.71 
 
 
478 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.71 
 
 
478 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 
539 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.69 
 
 
682 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.82 
 
 
537 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.69 
 
 
682 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.42 
 
 
535 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.69 
 
 
682 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.32 
 
 
685 aa  78.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2387  major facilitator transporter  25.81 
 
 
511 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
450 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  26.8 
 
 
530 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 
479 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.42 
 
 
516 aa  77  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.54 
 
 
615 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.87 
 
 
504 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.87 
 
 
498 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.7 
 
 
485 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.82 
 
 
541 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  34.69 
 
 
497 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  34.3 
 
 
477 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.76 
 
 
514 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.1 
 
 
505 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 
890 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  31.65 
 
 
515 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7581  putative multidrug transport protein  40.24 
 
 
477 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  32.57 
 
 
548 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.62 
 
 
592 aa  74.3  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  33.03 
 
 
484 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  32.4 
 
 
474 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.5 
 
 
523 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>