108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0774 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  51.42 
 
 
653 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  48.26 
 
 
657 aa  677    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  50.56 
 
 
648 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  52.58 
 
 
663 aa  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  53.95 
 
 
657 aa  701    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  47.88 
 
 
660 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  48.7 
 
 
662 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  45.51 
 
 
651 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  45.51 
 
 
651 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  51.32 
 
 
675 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  49.84 
 
 
657 aa  691    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  53.6 
 
 
654 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  52.99 
 
 
621 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  46.49 
 
 
658 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  46.82 
 
 
659 aa  646    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
677 aa  1373    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  47.76 
 
 
658 aa  660    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  52.93 
 
 
652 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  51.57 
 
 
648 aa  668    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  52.46 
 
 
661 aa  677    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  47.87 
 
 
655 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  47.86 
 
 
656 aa  698    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  47.23 
 
 
655 aa  655    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  45.94 
 
 
667 aa  633  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  46.01 
 
 
653 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  50.63 
 
 
653 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  46.39 
 
 
654 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  45.91 
 
 
661 aa  608  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  48.35 
 
 
1290 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.41 
 
 
661 aa  610  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  45.91 
 
 
661 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  50.4 
 
 
653 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  45.59 
 
 
661 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  45.75 
 
 
661 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  45.59 
 
 
661 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  45.91 
 
 
661 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.24 
 
 
617 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  47.54 
 
 
636 aa  592  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  43.14 
 
 
661 aa  588  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  44.51 
 
 
660 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  47.47 
 
 
631 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  47.53 
 
 
629 aa  548  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  43.65 
 
 
673 aa  548  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  44.99 
 
 
658 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  45.15 
 
 
658 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  43.44 
 
 
670 aa  542  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  44.5 
 
 
654 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  44.81 
 
 
626 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  45.16 
 
 
611 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  44.87 
 
 
655 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  42.1 
 
 
701 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  41.85 
 
 
696 aa  527  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  43.96 
 
 
641 aa  525  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  45.4 
 
 
625 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  45.4 
 
 
625 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  45.24 
 
 
625 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  44.53 
 
 
625 aa  519  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  41.12 
 
 
680 aa  518  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  41 
 
 
691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  44.54 
 
 
628 aa  512  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  43.24 
 
 
659 aa  510  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  40.97 
 
 
704 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  41.1 
 
 
704 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  40.98 
 
 
653 aa  498  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 
687 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  41.52 
 
 
607 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  44.01 
 
 
645 aa  471  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  40.48 
 
 
700 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  41.73 
 
 
669 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  42.51 
 
 
609 aa  452  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  35.63 
 
 
668 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.13 
 
 
663 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  38.17 
 
 
662 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.74 
 
 
666 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  38.69 
 
 
661 aa  438  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 
673 aa  438  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  37.87 
 
 
662 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  38.88 
 
 
663 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  38.02 
 
 
662 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 
657 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  37.67 
 
 
662 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
683 aa  392  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 
595 aa  270  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  27.99 
 
 
635 aa  239  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0510  conserved hypothetical beta-lactamase  36 
 
 
357 aa  223  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.618427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
591 aa  183  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0512  beta-lactamase domain protein  45.36 
 
 
225 aa  183  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 
444 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 
441 aa  160  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2022  Alkyl sulfatase and related hydrolase-like protein  27.51 
 
 
491 aa  147  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010234 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  23.9 
 
 
477 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
408 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0511  hypothetical protein  58.46 
 
 
67 aa  74.3  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  23.76 
 
 
414 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  24.32 
 
 
417 aa  61.6  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  23.57 
 
 
417 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  21.77 
 
 
417 aa  57.4  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 
273 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>