117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1566 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  55.09 
 
 		 243 aa  244  8e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  34.16 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  40.7 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0189  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  41.43 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  25.68 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  36.36 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  28.02 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  32.43 
 
 		 138 aa  53.1  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 146 aa  52  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 143 aa  52  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  29.49 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  37.33 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 142 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0419  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 146 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107138  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 		 148 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 		 148 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  38.24 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  29.51 
 
 		 246 aa  48.5  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  29.03 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  42.47 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  31.91 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  34.04 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 119 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  32.98 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  32.98 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  31.86 
 
 		 142 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 135 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3179  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.531372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  37.63 
 
 		 130 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 154 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  30.15 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  24.42 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  29.12 
 
 		 264 aa  45.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  38.18 
 
 		 170 aa  45.1  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4673  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 145 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156077  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 129 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  34.83 
 
 		 129 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 134 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  30.93 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  34.04 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  30.93 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  33.03 
 
 		 130 aa  43.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 131 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 137 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  32.84 
 
 		 140 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  31.91 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  29.52 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  37.97 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  40 
 
 		 142 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  33.03 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 146 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 134 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  41.07 
 
 		 159 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 141 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 147 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 133 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  36.36 
 
 		 143 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 		 121 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02196  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  40.38 
 
 		 148 aa  42.4  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  33.71 
 
 		 129 aa  42.4  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>