61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0777 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  100 
 
 
381 aa  773    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  71.99 
 
 
377 aa  534  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  42.89 
 
 
396 aa  299  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  43.26 
 
 
356 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  31.36 
 
 
353 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  33.42 
 
 
378 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  29.95 
 
 
361 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  24.54 
 
 
354 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  27.12 
 
 
382 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  27.12 
 
 
382 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  25.67 
 
 
345 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  27.07 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  26.67 
 
 
399 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  26.67 
 
 
399 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  26.22 
 
 
366 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  24.17 
 
 
341 aa  84  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  28.43 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  26.56 
 
 
356 aa  56.2  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  45 
 
 
423 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  46.81 
 
 
339 aa  52.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  45.45 
 
 
533 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  23.62 
 
 
419 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.73 
 
 
608 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0003  DNA replication and repair protein RecF  43.48 
 
 
350 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00329262  decreased coverage  0.000397503 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  50 
 
 
378 aa  47  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0002  DNA replication and repair protein RecF  43.48 
 
 
350 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  37.31 
 
 
782 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  37.88 
 
 
762 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  39.13 
 
 
376 aa  46.2  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1994  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.16 
 
 
590 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  22.6 
 
 
584 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  45.65 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  46.67 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  40.98 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  23.02 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2858  hypothetical protein  45.1 
 
 
371 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3860  ATPase-like  46.81 
 
 
370 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.247695  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3238  hypothetical protein  45.1 
 
 
371 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  43.4 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  32.88 
 
 
418 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.64 
 
 
420 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  43.48 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2610  hypothetical protein  38.64 
 
 
744 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  22.19 
 
 
323 aa  43.9  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  34.48 
 
 
416 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  45.24 
 
 
378 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1883  hypothetical protein  43.14 
 
 
369 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0003  recombination protein F  45 
 
 
364 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.26612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  48.72 
 
 
708 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4244  hypothetical protein  36.73 
 
 
538 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777185  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  46.51 
 
 
406 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3830  hypothetical protein  36.73 
 
 
534 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531313  hitchhiker  0.000259973 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0003  recombination protein F  45 
 
 
364 aa  43.5  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0185053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0539  SMC domain-containing protein  32.26 
 
 
391 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  41.86 
 
 
454 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  36.73 
 
 
650 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  19.22 
 
 
380 aa  43.1  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  33.87 
 
 
390 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0863  hypothetical protein  47.37 
 
 
223 aa  43.1  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03481  recombination protein F  45.24 
 
 
365 aa  43.1  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  31.51 
 
 
187 aa  42.7  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>