More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0479 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
427 aa  839    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 
436 aa  186  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  34.15 
 
 
441 aa  178  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  31.94 
 
 
436 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  33.25 
 
 
434 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  32.2 
 
 
440 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  31.35 
 
 
438 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  33.88 
 
 
408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
444 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  31.37 
 
 
421 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  31.93 
 
 
440 aa  156  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  32.14 
 
 
442 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  31.93 
 
 
440 aa  155  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  33.69 
 
 
420 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 
444 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 
453 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 
439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  32.24 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
444 aa  141  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
456 aa  140  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
457 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  29.75 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
444 aa  124  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  27.07 
 
 
394 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
444 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
433 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
432 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 
429 aa  97.8  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 
423 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.97 
 
 
441 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  30.37 
 
 
420 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  26.24 
 
 
1833 aa  87.8  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  29.38 
 
 
307 aa  86.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  22.47 
 
 
399 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  23.69 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  21.78 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  26.54 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  23.08 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  27.21 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  31.72 
 
 
424 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  28.77 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
482 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  27.27 
 
 
454 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.08 
 
 
403 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  24.5 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.76 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  26.04 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  26.04 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
482 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.92 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  24.8 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.42 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.48 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  27.99 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  29.14 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  31.82 
 
 
528 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  31.27 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  21.39 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.45 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  26.59 
 
 
419 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2009  major facilitator transporter  26.62 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0610699  normal  0.51216 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.21 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  25.94 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  25.27 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  26.56 
 
 
547 aa  77.4  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  28.29 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  26.32 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  28.44 
 
 
404 aa  77  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.76 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.21 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  21.57 
 
 
410 aa  76.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  31.47 
 
 
529 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.54 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.54 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  31.78 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  32.17 
 
 
535 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.27 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  21.1 
 
 
432 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  30.17 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  27.01 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
499 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  30.17 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  26.72 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  30.17 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  30.77 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  30.17 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  24.23 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.42 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  21.78 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>