More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5868 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
427 aa  847    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  50.69 
 
 
440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 
441 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  47.38 
 
 
450 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  52.06 
 
 
446 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 
432 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 
434 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  53.06 
 
 
441 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 
435 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 
447 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  54.35 
 
 
437 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  54.35 
 
 
437 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  48.75 
 
 
447 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  54.35 
 
 
437 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  52.2 
 
 
423 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  46.53 
 
 
443 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 
449 aa  378  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.83 
 
 
731 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  48.46 
 
 
448 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  47.92 
 
 
438 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  45.33 
 
 
441 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  49.42 
 
 
463 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  48.93 
 
 
447 aa  378  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  51.72 
 
 
485 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  51.2 
 
 
429 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  48.8 
 
 
435 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  54.52 
 
 
444 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 
447 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  47.42 
 
 
457 aa  368  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  47.43 
 
 
453 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  48.92 
 
 
461 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  48.16 
 
 
437 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  48.01 
 
 
443 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.06 
 
 
739 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.06 
 
 
734 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  47.18 
 
 
457 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  46.88 
 
 
445 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  46.95 
 
 
457 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  48.45 
 
 
444 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  48.81 
 
 
446 aa  364  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  47.16 
 
 
444 aa  363  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  45.12 
 
 
441 aa  364  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  45.56 
 
 
439 aa  364  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  50.48 
 
 
445 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  50.48 
 
 
445 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  50.48 
 
 
445 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.57 
 
 
734 aa  363  4e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 
505 aa  363  4e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  49.4 
 
 
456 aa  363  4e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  47.78 
 
 
434 aa  362  5.0000000000000005e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  49.2 
 
 
458 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  47.02 
 
 
446 aa  362  5.0000000000000005e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  46.52 
 
 
443 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  45.22 
 
 
440 aa  360  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  46.29 
 
 
454 aa  359  6e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  45.58 
 
 
431 aa  358  9e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  45.88 
 
 
432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  46.52 
 
 
443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  43.84 
 
 
445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1664  recombination factor protein RarA  46.19 
 
 
442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0526535  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.79 
 
 
726 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  46.03 
 
 
449 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  51.18 
 
 
427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  45.93 
 
 
455 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  46.75 
 
 
443 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  45.12 
 
 
425 aa  355  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  48.48 
 
 
445 aa  355  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.18 
 
 
733 aa  355  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  47.98 
 
 
422 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  48.08 
 
 
441 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  46.73 
 
 
443 aa  353  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  44.75 
 
 
432 aa  354  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  49.13 
 
 
419 aa  353  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  48.08 
 
 
441 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  43.88 
 
 
416 aa  353  4e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  46.75 
 
 
443 aa  353  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  47.75 
 
 
459 aa  352  5e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  47.84 
 
 
441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  46.75 
 
 
443 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  46 
 
 
443 aa  350  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.94 
 
 
721 aa  350  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  45.14 
 
 
451 aa  350  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  45.52 
 
 
446 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  47.72 
 
 
447 aa  350  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  47.6 
 
 
441 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  46.02 
 
 
445 aa  349  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  47.45 
 
 
451 aa  350  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  46.65 
 
 
426 aa  349  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  46.25 
 
 
443 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  45.56 
 
 
434 aa  349  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  51.42 
 
 
500 aa  348  7e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  50.12 
 
 
494 aa  348  8e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  46.9 
 
 
438 aa  348  9e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  46.25 
 
 
443 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.03 
 
 
735 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  47.23 
 
 
435 aa  348  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  41.94 
 
 
429 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  44.84 
 
 
449 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>