More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3551 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 196 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  37.79 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 193 aa  95.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  30.59 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  29.76 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  27.84 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  27.32 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  31.77 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  31.77 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  31.77 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  31.77 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  31.77 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  31.77 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  31.77 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  29.17 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  29.17 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  29.17 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  29.05 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  29.05 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  29.41 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  33.16 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  32.14 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  29.28 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  29.61 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  29.61 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  29.61 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  29.61 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  25.68 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  29.61 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  29.61 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  29.28 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  30.21 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  30.17 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  29.61 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  29.28 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  29.61 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  34.81 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2125  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  34.25 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  28.73 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  35.33 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  28.73 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  28.73 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  29.55 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  28.9 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  25.68 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.14 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  28.73 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  25.68 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.65 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  28.98 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  28.02 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  25.68 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  33.14 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  32.46 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>