More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2939 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2939  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 269 aa  526  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  33.64 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.02 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.6 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.75 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  38.65 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 273 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  26.4 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.6 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.38 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  32.79 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  31.54 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0430  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0855586  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  30.92 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  25.91 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  30.65 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  30.26 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  30.26 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  30.26 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  30.26 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 276 aa  98.6  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 258 aa  98.6  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  32.56 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  33.49 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  26.61 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 297 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 314 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 290 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 272 aa  95.9  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  26.21 
 
 		 252 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  34.39 
 
 		 252 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  32.07 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  30.87 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3480  transcriptional regulator, IclR family  26.22 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2434  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0257982  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.35 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  32.26 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.74 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  32.37 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  28.74 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  34.91 
 
 		 308 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0408  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.317858  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  28.35 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  32.84 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  23.79 
 
 		 248 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  28.96 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  28.41 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  32.14 
 
 		 299 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  23.2 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>