48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0353 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 228 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 193 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  40.44 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 196 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  38.86 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 213 aa  92  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  17.9 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  28.19 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 446 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 212 aa  42  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 237 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>