More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2413 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  100 
 
 
376 aa  762    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  59.47 
 
 
369 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  54.93 
 
 
371 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  58.89 
 
 
384 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  58.62 
 
 
384 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  55.7 
 
 
367 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  55.05 
 
 
370 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  57.78 
 
 
386 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.05 
 
 
386 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  57.82 
 
 
384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  57.82 
 
 
384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  58.2 
 
 
386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 
386 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  57.14 
 
 
389 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  55.79 
 
 
371 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  55.7 
 
 
371 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.7 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  53.19 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  57.29 
 
 
381 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  52.93 
 
 
371 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.29 
 
 
372 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  55 
 
 
372 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  52.53 
 
 
371 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  52.39 
 
 
371 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  55.03 
 
 
372 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  55.79 
 
 
371 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  55.35 
 
 
379 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0645  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.07 
 
 
354 aa  391  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.366147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.35 
 
 
379 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  55.03 
 
 
372 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  55.79 
 
 
371 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  55.03 
 
 
372 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.09 
 
 
372 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.09 
 
 
372 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.09 
 
 
372 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.09 
 
 
372 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.09 
 
 
372 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.09 
 
 
372 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  55.26 
 
 
372 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  53.19 
 
 
371 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  53.6 
 
 
365 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  55.85 
 
 
355 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  53.44 
 
 
368 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  53.19 
 
 
363 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  53.19 
 
 
363 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  53.72 
 
 
373 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  54.47 
 
 
359 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  53.35 
 
 
360 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  53.8 
 
 
357 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  49.87 
 
 
363 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  50 
 
 
368 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  50.13 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  48.94 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  47.87 
 
 
369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  50.27 
 
 
367 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  51.98 
 
 
357 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  52.8 
 
 
353 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1725  ABC transporter related  49.6 
 
 
361 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.897098 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  48.4 
 
 
369 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  50.93 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  53.3 
 
 
356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  48.29 
 
 
384 aa  350  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  48.93 
 
 
367 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  45.74 
 
 
369 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.81 
 
 
369 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  47.87 
 
 
366 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 
369 aa  346  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  49.87 
 
 
360 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  49.21 
 
 
358 aa  345  8.999999999999999e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  51.51 
 
 
345 aa  345  8.999999999999999e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  48.53 
 
 
360 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.3 
 
 
363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  50.13 
 
 
355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 
366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.66 
 
 
360 aa  342  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  51.17 
 
 
364 aa  342  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.17 
 
 
365 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.17 
 
 
365 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  50.65 
 
 
364 aa  342  8e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  47.99 
 
 
368 aa  342  8e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  48.53 
 
 
360 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  47.01 
 
 
366 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  48.4 
 
 
353 aa  341  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  46.28 
 
 
372 aa  340  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  48.54 
 
 
376 aa  340  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  49.87 
 
 
353 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  47.88 
 
 
354 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.47 
 
 
352 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  48.94 
 
 
357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  45.65 
 
 
370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.21 
 
 
369 aa  339  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  46.47 
 
 
366 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  48.94 
 
 
355 aa  339  5e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.38 
 
 
381 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  49.6 
 
 
353 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  49.33 
 
 
355 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  48.42 
 
 
356 aa  338  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  45.21 
 
 
367 aa  338  7e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  45.21 
 
 
367 aa  338  7e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  46.21 
 
 
356 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>