45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1258 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1258  hypothetical protein  100 
 
 		 633 aa  1207    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  35.56 
 
 		 1057 aa  81.6  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  33.71 
 
 		 681 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  33.33 
 
 		 897 aa  70.1  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  31.01 
 
 		 806 aa  70.5  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  38.57 
 
 		 946 aa  69.3  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  33.95 
 
 		 1036 aa  67.8  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  35.96 
 
 		 948 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  32.4 
 
 		 927 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  34.23 
 
 		 826 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  33.33 
 
 		 924 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  35.96 
 
 		 947 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  30.37 
 
 		 888 aa  63.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  33.58 
 
 		 964 aa  61.6  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  36.36 
 
 		 828 aa  61.2  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  31.3 
 
 		 914 aa  60.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  33.08 
 
 		 1027 aa  59.7  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  31.15 
 
 		 952 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  35.09 
 
 		 931 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  32.2 
 
 		 962 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  27.37 
 
 		 1245 aa  58.9  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  31.61 
 
 		 717 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  32.21 
 
 		 819 aa  57.8  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  31.93 
 
 		 692 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 		 822 aa  54.7  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  34 
 
 		 279 aa  53.5  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1041 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  34.38 
 
 		 737 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  37.12 
 
 		 683 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  30.08 
 
 		 933 aa  53.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  28.46 
 
 		 940 aa  51.6  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  28.95 
 
 		 883 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  31.73 
 
 		 889 aa  50.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  27.5 
 
 		 969 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  29.73 
 
 		 883 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  25.9 
 
 		 715 aa  48.9  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  30.7 
 
 		 673 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  32 
 
 		 938 aa  48.1  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  26.67 
 
 		 968 aa  47.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  27.74 
 
 		 959 aa  47.4  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.74 
 
 		 731 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  28.68 
 
 		 885 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  28.68 
 
 		 918 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  32.73 
 
 		 722 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  29.29 
 
 		 870 aa  43.9  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>