More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0786 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  100 
 
 
418 aa  827    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  66.67 
 
 
446 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  64.66 
 
 
446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  64.39 
 
 
413 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  64.39 
 
 
413 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  65.09 
 
 
416 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  64.39 
 
 
413 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  69.35 
 
 
419 aa  501  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  64.65 
 
 
412 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  64.62 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  67.11 
 
 
416 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  63.91 
 
 
404 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  64.04 
 
 
402 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  61.58 
 
 
405 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  65.7 
 
 
428 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  56.82 
 
 
450 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  51.11 
 
 
450 aa  398  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  53.13 
 
 
456 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  51.41 
 
 
441 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  47.01 
 
 
406 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  51.19 
 
 
428 aa  364  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  46.81 
 
 
412 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  51.7 
 
 
452 aa  362  8e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  50.38 
 
 
419 aa  352  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  49.62 
 
 
457 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  48.89 
 
 
426 aa  344  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  50.38 
 
 
461 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  48.14 
 
 
424 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  51.21 
 
 
418 aa  323  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  46.51 
 
 
432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  44.68 
 
 
420 aa  316  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  44.28 
 
 
414 aa  315  8e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  46.3 
 
 
413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  46.45 
 
 
424 aa  299  6e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  45.54 
 
 
452 aa  299  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  45.14 
 
 
476 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  48.64 
 
 
442 aa  293  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  43.65 
 
 
429 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 
403 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  44.85 
 
 
405 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  41.87 
 
 
509 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  42.02 
 
 
431 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  42.24 
 
 
441 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 
453 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 
475 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 
435 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
436 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  42.63 
 
 
426 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  42.63 
 
 
426 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 
417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  41.92 
 
 
450 aa  253  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  44.02 
 
 
412 aa  252  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
494 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  35.68 
 
 
426 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  37.6 
 
 
429 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  39.68 
 
 
491 aa  212  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 
431 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  38.15 
 
 
418 aa  210  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 
423 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 
433 aa  209  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  35.54 
 
 
441 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 
421 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  35.97 
 
 
447 aa  206  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  34.24 
 
 
412 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 
412 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 
440 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  32.11 
 
 
403 aa  203  5e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  34.01 
 
 
474 aa  202  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  31.81 
 
 
430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 
428 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  33 
 
 
446 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 
410 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 
440 aa  193  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  35.58 
 
 
413 aa  192  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  31.93 
 
 
410 aa  192  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
419 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 
418 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  33.09 
 
 
431 aa  189  8e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
442 aa  187  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  31.63 
 
 
436 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  35.38 
 
 
474 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 
401 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  36.27 
 
 
426 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
415 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  33.25 
 
 
429 aa  177  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  39.65 
 
 
425 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 
409 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  34.61 
 
 
413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  33.58 
 
 
428 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
417 aa  169  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  30.92 
 
 
424 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 
404 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  30.37 
 
 
418 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 
421 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  32.18 
 
 
424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
413 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  34.67 
 
 
414 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
417 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>