223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7071 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  46.45 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  46.96 
 
 		 187 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  44.94 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  39.78 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  43.41 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  40.11 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  42.86 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  41.3 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  41.44 
 
 		 187 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  38.67 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  38.67 
 
 		 189 aa  147  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  37.57 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  37.02 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  42.22 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  37.97 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  33.16 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  34.62 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  30.69 
 
 		 193 aa  101  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  32.2 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5633  protein of unknown function DUF179  35.66 
 
 		 146 aa  99.8  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591685  normal  0.939371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  36.07 
 
 		 196 aa  95.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  30.29 
 
 		 186 aa  92.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  32.76 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  91.3  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  30.86 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  29.17 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  30.5 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  31.61 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  31.89 
 
 		 200 aa  88.2  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  28.8 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  30.06 
 
 		 190 aa  87.8  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  31.03 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  34.32 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  34.32 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  34.32 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  30.06 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  27.59 
 
 		 186 aa  87.4  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  30 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  30.46 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  33.14 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  33.14 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  33.14 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  33.14 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  33.73 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48166  predicted protein  30.37 
 
 		 393 aa  85.9  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  31.77 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  32.14 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  29.31 
 
 		 191 aa  84.7  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  30.51 
 
 		 188 aa  84.3  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  27.81 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  29.95 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  30.77 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  33.52 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  28.72 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  27.66 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  27.59 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  29.94 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  33.52 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  30.46 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  31.07 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  28 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  31.64 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  29.55 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  28.82 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  28.32 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  30.81 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  28.41 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  28.18 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  30.06 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  29.48 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  28.18 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  28.57 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  32.6 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  26.06 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  31.82 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  30.69 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  31.14 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  31.64 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  29.51 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  27.13 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  27.17 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  31.07 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  28.02 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  28.65 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  29.41 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  32.62 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  27.47 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  30.95 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  27.62 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  27.62 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  28.4 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  30.51 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  28.49 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  32.37 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  27.62 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  27.62 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  27.62 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>