57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6627 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  100 
 
 
523 aa  1078    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  30 
 
 
757 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  30.51 
 
 
1029 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  29.21 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  26.82 
 
 
1433 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  29.12 
 
 
1003 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  25 
 
 
1668 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  27.65 
 
 
1147 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  27.47 
 
 
495 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.4 
 
 
665 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  29.19 
 
 
341 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  30.86 
 
 
634 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  26.67 
 
 
336 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  25.71 
 
 
755 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  27.55 
 
 
657 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  26.42 
 
 
362 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  29.1 
 
 
394 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  26.59 
 
 
646 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  26.8 
 
 
491 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  27.57 
 
 
933 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  27.06 
 
 
1174 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  25.51 
 
 
501 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  27.11 
 
 
543 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  26.83 
 
 
803 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  25.33 
 
 
340 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  24.7 
 
 
333 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  27.71 
 
 
1263 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  24.26 
 
 
1437 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  24.55 
 
 
601 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.26 
 
 
1783 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  30.54 
 
 
647 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  28.49 
 
 
367 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  26.51 
 
 
1055 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.67 
 
 
1015 aa  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  25.44 
 
 
688 aa  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  35.34 
 
 
398 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  25.93 
 
 
571 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  27.59 
 
 
541 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  27.81 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  26.42 
 
 
221 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.12 
 
 
900 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  23.9 
 
 
725 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  28.81 
 
 
230 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  24.75 
 
 
477 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  28.35 
 
 
428 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  23.84 
 
 
1215 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.98 
 
 
1773 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  26.26 
 
 
996 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  24.86 
 
 
1296 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  27.81 
 
 
558 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  28.22 
 
 
876 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1739  hypothetical protein  28.3 
 
 
264 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.800192  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  26.06 
 
 
371 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  25.95 
 
 
701 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  27.75 
 
 
347 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  24.45 
 
 
254 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  23.68 
 
 
1294 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>