88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6259 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6259  Peptidase M23  100 
 
 
308 aa  629  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485379  normal  0.820011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3642  Peptidase M23  36.91 
 
 
339 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3591  peptidase M23B  45.39 
 
 
302 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0942  peptidase M23B  29.34 
 
 
321 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0501696  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0711  Peptidase M23  37.86 
 
 
340 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  29.05 
 
 
286 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1691  cell wall endopeptidase  36.88 
 
 
286 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1872  peptidase, M23/M37 family  37.18 
 
 
187 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1742  M24/M37 family peptidase  36.25 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1879  M23/37 family peptidase  36.25 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2599  peptidase M23  37.41 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1914  peptidase, M23/M37 family  36.25 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000487 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1717  cell wall endopeptidase  36.25 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.402348  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  36.84 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  36.84 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1987  peptidase, M23/M37 family  35.26 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.431203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3471  peptidase, M23/M37 family  34.67 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239412  hitchhiker  0.000000108931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0268  Peptidase M23  31.45 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.839567 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  31.87 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3404  Peptidase M23  26.63 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1320  hypothetical protein  35.29 
 
 
230 aa  63.2  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2463  hypothetical protein  33.33 
 
 
399 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2320  hypothetical protein  33.86 
 
 
399 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  33.06 
 
 
502 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12860  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.61 
 
 
281 aa  60.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2536  Peptidase M23  34.4 
 
 
413 aa  59.7  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  30.67 
 
 
398 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  33.96 
 
 
404 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1462  peptidase M23B  49.12 
 
 
111 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0490484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27670  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.17 
 
 
279 aa  57  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2205  Peptidase M23  25.73 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1538  Peptidase M23  29.5 
 
 
362 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000553648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  32.21 
 
 
995 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2837  Peptidase M23  33.58 
 
 
424 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000204146  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  33.12 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  37.65 
 
 
281 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0377  Peptidase M23  32.5 
 
 
409 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2558  peptidase M23B  45.16 
 
 
351 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  29.93 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  43.75 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  28.48 
 
 
298 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  34.25 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  30.06 
 
 
298 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  52.17 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2172  Peptidase M23  40 
 
 
342 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  32.79 
 
 
346 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2234  Peptidase M23  55.26 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.417932  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  49.06 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  41.67 
 
 
290 aa  45.8  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  41.67 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  31.96 
 
 
436 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  41.67 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  34.09 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  43.75 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  32.29 
 
 
439 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2189  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.62 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  46.94 
 
 
999 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  51.28 
 
 
249 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  37.7 
 
 
412 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  35.82 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  44.9 
 
 
372 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1511  cell wall endopeptidase, family M23/M37  46.34 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0605287 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0260  peptidoglycan hydrolase  32.39 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  34.12 
 
 
388 aa  43.5  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0267  peptidoglycan hydrolase  32.39 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578781  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  38.71 
 
 
454 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  28.87 
 
 
378 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  30.93 
 
 
425 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  38.71 
 
 
454 aa  43.5  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  32.99 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  32.99 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  38.36 
 
 
414 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  28.46 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  33.07 
 
 
268 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  44.19 
 
 
309 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  34.33 
 
 
334 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  37.7 
 
 
1510 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  37.7 
 
 
1510 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  52.5 
 
 
313 aa  42.7  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  52.38 
 
 
236 aa  42.7  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  34.67 
 
 
441 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1705  Peptidase M23  47.06 
 
 
360 aa  42.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  36.07 
 
 
425 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  50 
 
 
285 aa  42.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7968  Peptidase M23  31.96 
 
 
338 aa  42.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  31.13 
 
 
299 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  31.13 
 
 
299 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  44.9 
 
 
305 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>