More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5402 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
234 aa  485  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  52.42 
 
 
257 aa  246  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  49.13 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  50.22 
 
 
258 aa  235  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  51.29 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  49.34 
 
 
252 aa  231  1e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  45.26 
 
 
253 aa  222  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  46.32 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  45.73 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  46.52 
 
 
263 aa  211  9e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 
254 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  43.35 
 
 
254 aa  205  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
284 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
293 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 
315 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  27.45 
 
 
291 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.4 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.4 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3765  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00546797  normal  0.0830627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1445  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  26.21 
 
 
278 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 
258 aa  79  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
294 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  25.4 
 
 
303 aa  78.6  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  24.05 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.14 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
299 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  24.31 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
299 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
290 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
299 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  25 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  26.29 
 
 
257 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  26.29 
 
 
257 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.27 
 
 
372 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  24.69 
 
 
275 aa  75.1  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  26.29 
 
 
257 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  26.69 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.56 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  22.26 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.63 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  23.39 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  24.69 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  21.09 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.41 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483911  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 
317 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  22.18 
 
 
304 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
264 aa  72  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 
264 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  21.79 
 
 
290 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.08 
 
 
331 aa  72  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 
308 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
290 aa  71.6  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.52 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.31 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  21.79 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  20.39 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  23.87 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.14 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.14 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  23.14 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>