More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0520 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  36.42 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  35.63 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  37.43 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  35.26 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01170  hypothetical protein  40.98 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1659  cytochrome c oxidase, subunit III  39.05 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  33.53 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  31.4 
 
 		 202 aa  88.2  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 229 aa  88.2  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  27.01 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  32.02 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  28.07 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  27.65 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  28.41 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  29.88 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  33.54 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  34.94 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  30.77 
 
 		 204 aa  72  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  32.43 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  30.53 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  33.95 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  31.33 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  33.93 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  33.93 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  34.55 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  26.86 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  25.6 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  27.92 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  30.11 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  30.27 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1857  Cytochrome-c oxidase  24.26 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  26.88 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  26.88 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  28.04 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  27.32 
 
 		 832 aa  65.5  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  30.33 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  29.17 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  25.79 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  29.57 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  28.95 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  27.33 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  29.07 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  32.09 
 
 		 294 aa  64.7  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  26.84 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  30.33 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  26.23 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  28.23 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  27.93 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3993  cytochrome c oxidase subunit III  22.47 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.115102  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  30.49 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  29.35 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  26.88 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  28.26 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  28.8 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  28.11 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  28.85 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  30.49 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  26.35 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  32.75 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  28.11 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  28.11 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0765  cytochrome c oxidase subunit I  34.35 
 
 		 790 aa  62.4  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0136458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  23.76 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  26.46 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  29.15 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  27.89 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  26.7 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  29.71 
 
 		 295 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  30.71 
 
 		 295 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  28.99 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  26.98 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  31.62 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  30.71 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  29.5 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  30.53 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  25.75 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  26.9 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  28.99 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  23.76 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  24.26 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  29.85 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  27.75 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0029  cytochrome c oxidase, subunit III  28.46 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  23.76 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  29.09 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  28.46 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  26.84 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  30.23 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  27.66 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  28.78 
 
 		 295 aa  58.2  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  31.01 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  27.27 
 
 		 275 aa  57.8  0.00000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>