More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0466 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  57.16 
 
 		 673 aa  669    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.91 
 
 		 685 aa  798    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.62 
 
 		 696 aa  883    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.57 
 
 		 697 aa  696    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.78 
 
 		 676 aa  817    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  56.16 
 
 		 691 aa  697    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  59 
 
 		 691 aa  744    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  60.09 
 
 		 692 aa  787    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.81 
 
 		 641 aa  680    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 673 aa  1380    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.42 
 
 		 652 aa  714    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  51.1 
 
 		 883 aa  626  1e-178  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.63 
 
 		 697 aa  628  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  53.24 
 
 		 817 aa  624  1e-177  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.38 
 
 		 694 aa  624  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.6 
 
 		 699 aa  622  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82096  AAA+-type ATPase  50.54 
 
 		 787 aa  622  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.83 
 
 		 686 aa  615  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  52.38 
 
 		 706 aa  616  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  61.28 
 
 		 699 aa  615  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  51.91 
 
 		 694 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23646  predicted protein  51.19 
 
 		 648 aa  607  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34770  Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein RCA1 (TAT-binding homolog 12)  52.5 
 
 		 867 aa  601  1e-170  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00577984  normal  0.0143281 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13471  predicted protein  65.97 
 
 		 476 aa  580  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155639  normal  0.170565 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16391  predicted protein  55.12 
 
 		 590 aa  570  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.74 
 
 		 696 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  47.57 
 
 		 646 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.74 
 
 		 714 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.36 
 
 		 647 aa  555  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.86 
 
 		 658 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  53.75 
 
 		 692 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  46.51 
 
 		 627 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.69 
 
 		 639 aa  540  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  52.04 
 
 		 608 aa  537  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.77 
 
 		 663 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.77 
 
 		 663 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.98 
 
 		 676 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  46.86 
 
 		 635 aa  535  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.13 
 
 		 607 aa  535  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  52.9 
 
 		 614 aa  528  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.37 
 
 		 635 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.87 
 
 		 655 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.21 
 
 		 658 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.67 
 
 		 655 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.21 
 
 		 658 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.25 
 
 		 621 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  47.37 
 
 		 700 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  52.65 
 
 		 638 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.66 
 
 		 612 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.45 
 
 		 630 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.22 
 
 		 602 aa  521  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  52.93 
 
 		 659 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.68 
 
 		 635 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.4 
 
 		 706 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.59 
 
 		 666 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.59 
 
 		 666 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.39 
 
 		 666 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.56 
 
 		 645 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  50.59 
 
 		 917 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.47 
 
 		 612 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.98 
 
 		 662 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  50.09 
 
 		 645 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.59 
 
 		 852 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.07 
 
 		 648 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.15 
 
 		 615 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.59 
 
 		 666 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.59 
 
 		 666 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 		 643 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  50.98 
 
 		 658 aa  512  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 		 646 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.61 
 
 		 697 aa  512  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  50.38 
 
 		 624 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 		 646 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.61 
 
 		 697 aa  512  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  52.26 
 
 		 617 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.69 
 
 		 687 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  49.26 
 
 		 613 aa  514  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  51.1 
 
 		 702 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.23 
 
 		 610 aa  514  1e-144  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 639 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.5 
 
 		 705 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.3 
 
 		 621 aa  510  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.04 
 
 		 618 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  49.34 
 
 		 641 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.9 
 
 		 617 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.29 
 
 		 629 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.53 
 
 		 638 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  52.06 
 
 		 617 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.24 
 
 		 635 aa  510  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  46.04 
 
 		 615 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.79 
 
 		 631 aa  508  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  50.1 
 
 		 629 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  52.06 
 
 		 617 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.53 
 
 		 638 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.89 
 
 		 630 aa  509  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.29 
 
 		 645 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.43 
 
 		 640 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  51.91 
 
 		 625 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.27 
 
 		 652 aa  510  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  47.32 
 
 		 652 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>