More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3272 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3272  DNA topoisomerase  100 
 
 		 721 aa  1474    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000113059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  34.48 
 
 		 746 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  32.71 
 
 		 731 aa  350  5e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  32.44 
 
 		 799 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  32.71 
 
 		 731 aa  346  8e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  32.4 
 
 		 721 aa  346  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  31.31 
 
 		 686 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  30.69 
 
 		 695 aa  343  9e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  29.81 
 
 		 701 aa  340  4e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  31.51 
 
 		 722 aa  331  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  30.99 
 
 		 729 aa  326  9e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  30.56 
 
 		 873 aa  326  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  31.49 
 
 		 730 aa  326  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  30.95 
 
 		 729 aa  324  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  30.52 
 
 		 729 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  30.57 
 
 		 729 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  30.71 
 
 		 729 aa  319  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  30.39 
 
 		 729 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  30.91 
 
 		 854 aa  318  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  30.43 
 
 		 729 aa  317  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  30.43 
 
 		 729 aa  317  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  30.43 
 
 		 729 aa  317  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  30.09 
 
 		 729 aa  317  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  30.43 
 
 		 729 aa  317  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  30.43 
 
 		 729 aa  317  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  30.98 
 
 		 839 aa  313  7.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  29.18 
 
 		 620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1318  DNA topoisomerase III  29.8 
 
 		 805 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000791242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  33.33 
 
 		 608 aa  307  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  29.81 
 
 		 718 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  29.19 
 
 		 754 aa  303  8.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  30.06 
 
 		 867 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  30.65 
 
 		 891 aa  301  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  30.99 
 
 		 714 aa  299  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  30.12 
 
 		 908 aa  299  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  31.98 
 
 		 768 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  30.4 
 
 		 865 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  30.12 
 
 		 865 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  30.4 
 
 		 865 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  30.15 
 
 		 896 aa  298  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  30.4 
 
 		 865 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  30.4 
 
 		 865 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  30.4 
 
 		 865 aa  297  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  29.72 
 
 		 1002 aa  295  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  30.26 
 
 		 865 aa  294  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  30.17 
 
 		 869 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  30.17 
 
 		 869 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  30.17 
 
 		 869 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  30.17 
 
 		 869 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  30.17 
 
 		 869 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  30.56 
 
 		 891 aa  293  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  30.17 
 
 		 869 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  29.77 
 
 		 906 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  31.06 
 
 		 889 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  31.06 
 
 		 888 aa  292  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1814  DNA topoisomerase III  28.82 
 
 		 653 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230615  normal  0.182925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  29 
 
 		 975 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3624  DNA topoisomerase III  28.92 
 
 		 652 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203006  normal  0.930533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4019  DNA topoisomerase III  28.63 
 
 		 653 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1767  DNA topoisomerase III  31.28 
 
 		 714 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1725  DNA topoisomerase III  31.28 
 
 		 714 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1905  DNA topoisomerase III  31.28 
 
 		 714 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000492134  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  30.63 
 
 		 711 aa  289  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  30.63 
 
 		 711 aa  289  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  31.3 
 
 		 876 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1911  DNA topoisomerase III  31.28 
 
 		 714 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129988  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  29.12 
 
 		 981 aa  288  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  30.66 
 
 		 877 aa  287  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1744  DNA topoisomerase III  31.28 
 
 		 714 aa  287  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  31.13 
 
 		 714 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3433  DNA topoisomerase III  31.28 
 
 		 714 aa  287  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000032124  hitchhiker  0.00000000499159 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  31.38 
 
 		 714 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000939771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  31.13 
 
 		 714 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  29.55 
 
 		 697 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  31.13 
 
 		 714 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3423  DNA topoisomerase III  28.08 
 
 		 654 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  31.36 
 
 		 777 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  31.02 
 
 		 876 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0033  putative DNA topoisomerase III  29.73 
 
 		 815 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  29.43 
 
 		 980 aa  282  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1836  DNA topoisomerase III  29.94 
 
 		 711 aa  282  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000886336  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  29.3 
 
 		 675 aa  281  4e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  30.03 
 
 		 876 aa  280  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  29.01 
 
 		 920 aa  280  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  29.66 
 
 		 990 aa  279  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  28.39 
 
 		 846 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  30.54 
 
 		 851 aa  278  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  28.69 
 
 		 981 aa  278  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  29.06 
 
 		 982 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0911  DNA topoisomerase  28.53 
 
 		 741 aa  278  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  28.99 
 
 		 879 aa  278  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  30.59 
 
 		 707 aa  277  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  28.59 
 
 		 869 aa  276  7e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  28.94 
 
 		 876 aa  276  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  27.38 
 
 		 920 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  30.11 
 
 		 939 aa  273  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27190  DNA topoisomerase III  27.79 
 
 		 650 aa  272  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  29.46 
 
 		 992 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  30.56 
 
 		 719 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  29.27 
 
 		 744 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>