More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3095 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  52.55 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  48.8 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  51.44 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  41.51 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  47.26 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  39.11 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  43.56 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  38.61 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 232 aa  134  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  38.58 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 232 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 223 aa  121  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 225 aa  118  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 228 aa  111  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  31.11 
 
 		 269 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 223 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 228 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  33.88 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 222 aa  104  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  34.59 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2765  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal  0.0102219 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  34.59 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>