More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2365 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2365  arsenite oxidase, large subunit  100 
 
 		 853 aa  1773    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0382  arsenite oxidase, large subunit  81.71 
 
 		 854 aa  1500    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000386632  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0377  arsenite oxidase, large subunit  58.04 
 
 		 861 aa  1048    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.103982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5678  arsenite oxidase, large subunit  37.6 
 
 		 829 aa  538  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5704  arsenite oxidase, large subunit  37.02 
 
 		 829 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3084  arsenate reductase (azurin)  36.17 
 
 		 827 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4427  arsenate reductase (azurin)  36.43 
 
 		 820 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3950  arsenite oxidase large subunit  36.01 
 
 		 820 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1369  molydopterin dinucleotide-binding region  33.3 
 
 		 1026 aa  456  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.408174 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.99 
 
 		 677 aa  193  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  26.07 
 
 		 695 aa  184  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.76 
 
 		 674 aa  184  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.5 
 
 		 674 aa  183  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.5 
 
 		 674 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  24.61 
 
 		 689 aa  182  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  24.56 
 
 		 724 aa  180  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.36 
 
 		 674 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.26 
 
 		 893 aa  175  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.91 
 
 		 688 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.21 
 
 		 754 aa  172  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.45 
 
 		 686 aa  172  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  24.22 
 
 		 687 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  24.38 
 
 		 746 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.76 
 
 		 688 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  24.56 
 
 		 746 aa  167  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.73 
 
 		 879 aa  167  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.22 
 
 		 1410 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.05 
 
 		 688 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  23.93 
 
 		 1180 aa  164  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.52 
 
 		 900 aa  163  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  24.53 
 
 		 1171 aa  164  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.44 
 
 		 676 aa  163  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.44 
 
 		 676 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.43 
 
 		 676 aa  161  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.13 
 
 		 1110 aa  158  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.44 
 
 		 994 aa  158  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  24.38 
 
 		 761 aa  156  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.59 
 
 		 1130 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  23.18 
 
 		 1228 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  23.35 
 
 		 729 aa  155  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1795  molybdopterin oxidoreductase  25.67 
 
 		 526 aa  155  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.25 
 
 		 689 aa  155  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.09 
 
 		 687 aa  154  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1056  periplasmic nitrate reductase, large subunit  23.51 
 
 		 770 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.56 
 
 		 721 aa  152  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.03 
 
 		 893 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.02 
 
 		 1428 aa  151  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.25 
 
 		 686 aa  151  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4046  molybdopterin oxidoreductase  23.68 
 
 		 779 aa  152  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.67 
 
 		 920 aa  151  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  22.51 
 
 		 745 aa  151  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  23.93 
 
 		 1383 aa  150  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  22.61 
 
 		 1188 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  23.26 
 
 		 879 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.56 
 
 		 917 aa  149  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.27 
 
 		 1440 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  23.86 
 
 		 734 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  24.59 
 
 		 727 aa  149  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.21 
 
 		 687 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  23 
 
 		 1338 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  23.78 
 
 		 1271 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.08 
 
 		 1440 aa  147  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.51 
 
 		 668 aa  147  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  23.78 
 
 		 1271 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.07 
 
 		 1111 aa  147  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.38 
 
 		 1406 aa  147  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  23.22 
 
 		 899 aa  147  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.85 
 
 		 724 aa  147  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  24.41 
 
 		 715 aa  147  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  23.84 
 
 		 1271 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2493  molybdopterin oxidoreductase  22.64 
 
 		 880 aa  146  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4449  molybdopterin oxidoreductase  23.14 
 
 		 870 aa  146  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.44 
 
 		 1424 aa  145  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  25.06 
 
 		 706 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.36 
 
 		 685 aa  145  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  23.89 
 
 		 715 aa  145  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  23.89 
 
 		 715 aa  145  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  24.36 
 
 		 1405 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.89 
 
 		 715 aa  145  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  23.89 
 
 		 715 aa  145  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  23.89 
 
 		 715 aa  145  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0398  molybdopterin oxidoreductase  25.81 
 
 		 862 aa  145  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.81 
 
 		 1432 aa  145  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  24.49 
 
 		 1396 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  22.61 
 
 		 1357 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  22.59 
 
 		 1387 aa  144  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.39 
 
 		 1426 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2823  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  23.8 
 
 		 897 aa  143  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  24.36 
 
 		 715 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.15 
 
 		 898 aa  143  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.77 
 
 		 715 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.24 
 
 		 886 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.62 
 
 		 904 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  24.48 
 
 		 1385 aa  142  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  25.89 
 
 		 762 aa  142  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  24.04 
 
 		 1317 aa  142  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.52 
 
 		 1432 aa  142  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.79 
 
 		 979 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2729  molybdopterin oxidoreductase  24.08 
 
 		 902 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  23.61 
 
 		 752 aa  141  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>