More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2034 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
258 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  81.4 
 
 
265 aa  457  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  81.78 
 
 
258 aa  455  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  78.17 
 
 
272 aa  431  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  75.39 
 
 
259 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  74.31 
 
 
257 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  71.26 
 
 
263 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  49.21 
 
 
293 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  41.53 
 
 
250 aa  221  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  43.53 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 
259 aa  219  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  42.06 
 
 
259 aa  214  9e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  42.19 
 
 
287 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 
247 aa  204  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  40.94 
 
 
255 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  42.23 
 
 
250 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  42.23 
 
 
250 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  40.16 
 
 
258 aa  201  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  41.46 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  41.3 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  42 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  40.56 
 
 
252 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 
252 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  41.2 
 
 
248 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
251 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 
252 aa  188  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  40.4 
 
 
263 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  39.02 
 
 
259 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  38.64 
 
 
281 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  38.64 
 
 
281 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  40.65 
 
 
250 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  40.08 
 
 
264 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
258 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  38.08 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 
251 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 
250 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 
253 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  38.65 
 
 
262 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 
259 aa  180  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 
253 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  38.06 
 
 
258 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  38.96 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  43.48 
 
 
257 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
253 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
253 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
253 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
253 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 
248 aa  178  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 
253 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  39.45 
 
 
258 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 
251 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 
247 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
270 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  39.68 
 
 
245 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  38.08 
 
 
265 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  37.25 
 
 
259 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
258 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 
251 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 
253 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 
251 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
258 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 
255 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  38.06 
 
 
253 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  38.2 
 
 
269 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 
253 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 
253 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 
247 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  36.22 
 
 
258 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  38.98 
 
 
257 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  38.06 
 
 
249 aa  174  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 
253 aa  174  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_002950  PG2163  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  37.16 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  37.35 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  40.73 
 
 
251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  36.4 
 
 
259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  38.06 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  39.44 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  37.65 
 
 
257 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  37.4 
 
 
269 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  37.79 
 
 
270 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
249 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  38.82 
 
 
259 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 
247 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 
248 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>