More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2158 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 209 aa  428  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  75.49 
 
 		 218 aa  343  8e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  76.47 
 
 		 218 aa  337  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  69.31 
 
 		 237 aa  307  8e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  66.03 
 
 		 227 aa  293  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  59.79 
 
 		 217 aa  255  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  59.79 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  57.81 
 
 		 220 aa  245  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  55.02 
 
 		 216 aa  245  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  56.86 
 
 		 217 aa  244  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  58.76 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  56.86 
 
 		 217 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  54.55 
 
 		 217 aa  241  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  53.59 
 
 		 217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  56.37 
 
 		 217 aa  238  4e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  57.73 
 
 		 217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  50.72 
 
 		 212 aa  225  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  53.61 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.31 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  47.06 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  39.68 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0069  endonuclease III  46.07 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  39.23 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  39.23 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  39.23 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  39.23 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  38.76 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  39.23 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  39.23 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  38.76 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  38.76 
 
 		 215 aa  157  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  41.71 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  41.71 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  38.76 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  40.74 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  41.36 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  42.86 
 
 		 235 aa  155  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  41.71 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  41.76 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  44.74 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  42.78 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  43.62 
 
 		 215 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  43.65 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  39.9 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  39.77 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  39.27 
 
 		 256 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.15 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  40.32 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  38.22 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  41.24 
 
 		 197 aa  149  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  43.62 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  44.15 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  44.15 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  44.15 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  44.15 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  44.15 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  44.15 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  44.15 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  43.62 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  43.62 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  44.26 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  43.62 
 
 		 214 aa  148  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.74 
 
 		 258 aa  147  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  43.09 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  43.96 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  41.49 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  43.09 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  43.32 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.32 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  37.7 
 
 		 256 aa  145  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  43.09 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  41.12 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  42.93 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  37.7 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  45.05 
 
 		 213 aa  144  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  43.09 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.74 
 
 		 241 aa  144  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  43.46 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  40.82 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  38.42 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  41.57 
 
 		 239 aa  143  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  42.93 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  43.17 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  41 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  38.62 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.46 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  38.38 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.96 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  43.96 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  41.76 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  43.96 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  43.96 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  42.55 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  41.94 
 
 		 228 aa  141  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>