More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1271 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  50.74 
 
 		 709 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1271  Oligopeptidase A  100 
 
 		 671 aa  1397    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  57.25 
 
 		 675 aa  753    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05555  peptidyl-dipeptidase  52.1 
 
 		 674 aa  671    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.41 
 
 		 714 aa  589  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.18 
 
 		 727 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.88 
 
 		 729 aa  566  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.08 
 
 		 742 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.33 
 
 		 726 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.93 
 
 		 742 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.78 
 
 		 742 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.18 
 
 		 726 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.18 
 
 		 734 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.48 
 
 		 726 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.02 
 
 		 734 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.87 
 
 		 734 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.72 
 
 		 734 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.73 
 
 		 725 aa  551  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.01 
 
 		 848 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_002950  PG1789  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.81 
 
 		 678 aa  542  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.93 
 
 		 730 aa  535  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.62 
 
 		 736 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  38.22 
 
 		 694 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.87 
 
 		 723 aa  478  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  40.06 
 
 		 681 aa  477  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.02 
 
 		 723 aa  478  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.61 
 
 		 687 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  38.86 
 
 		 722 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.69 
 
 		 695 aa  475  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38.91 
 
 		 695 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  38.2 
 
 		 686 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.76 
 
 		 689 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.21 
 
 		 689 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  37.35 
 
 		 680 aa  468  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.92 
 
 		 712 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.3 
 
 		 682 aa  467  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  37.61 
 
 		 682 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  36.76 
 
 		 680 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  36.76 
 
 		 680 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  36.76 
 
 		 680 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.78 
 
 		 671 aa  460  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  37.05 
 
 		 680 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  36.9 
 
 		 680 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  36.76 
 
 		 680 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  36.76 
 
 		 680 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.3 
 
 		 682 aa  458  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  37.63 
 
 		 680 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.15 
 
 		 733 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  36.76 
 
 		 680 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  36.76 
 
 		 680 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  36.61 
 
 		 680 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  36.76 
 
 		 680 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  37.13 
 
 		 682 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  37.97 
 
 		 733 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  36.76 
 
 		 680 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.05 
 
 		 683 aa  458  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  37.83 
 
 		 679 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.08 
 
 		 696 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  36.28 
 
 		 679 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.08 
 
 		 696 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.19 
 
 		 696 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  36.73 
 
 		 679 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  36.16 
 
 		 680 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  37.21 
 
 		 683 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  36.16 
 
 		 680 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  38.58 
 
 		 693 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  39.17 
 
 		 692 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  36.31 
 
 		 680 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  35.63 
 
 		 683 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  36.31 
 
 		 680 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.32 
 
 		 694 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  36.49 
 
 		 679 aa  451  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  36.16 
 
 		 680 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  35.68 
 
 		 682 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  38.1 
 
 		 685 aa  452  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  36.64 
 
 		 682 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  36.63 
 
 		 683 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  36.87 
 
 		 681 aa  448  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  35.59 
 
 		 695 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.05 
 
 		 696 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  37.02 
 
 		 676 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  36.13 
 
 		 679 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  36.87 
 
 		 679 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  36.87 
 
 		 679 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.38 
 
 		 718 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  36.48 
 
 		 681 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  36.47 
 
 		 683 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.81 
 
 		 716 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  35.43 
 
 		 679 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.24 
 
 		 718 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.18 
 
 		 681 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.97 
 
 		 716 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  36.34 
 
 		 679 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  35.59 
 
 		 680 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  36.04 
 
 		 679 aa  445  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  36.73 
 
 		 679 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  36.35 
 
 		 681 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  35.68 
 
 		 694 aa  441  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  35.42 
 
 		 680 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  35.82 
 
 		 716 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>