284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0883 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 389 aa  806    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  33.92 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.54 
 
 		 451 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1499  DNA-cytosine methyltransferase  30.45 
 
 		 703 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  26.89 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  36.68 
 
 		 719 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  39.01 
 
 		 483 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.77 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0393  DNA-cytosine methyltransferase  36.22 
 
 		 719 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1364  DNA methyltransferase  24.15 
 
 		 535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  27.13 
 
 		 727 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  27.13 
 
 		 331 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  35.58 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  39.36 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  27.89 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  25.5 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  26.49 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  40.36 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  40.36 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  33.57 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  30.48 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  35.54 
 
 		 490 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  35.93 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 		 372 aa  99.8  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  35.54 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  34.94 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  26.34 
 
 		 318 aa  99.4  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  23.96 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  26.68 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  36 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  29.45 
 
 		 487 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  30.94 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  35.76 
 
 		 416 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  25.65 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  35.12 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  33.71 
 
 		 345 aa  96.3  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  34.55 
 
 		 323 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.9 
 
 		 308 aa  94  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 		 426 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.67 
 
 		 357 aa  94  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  34.44 
 
 		 416 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  32.32 
 
 		 315 aa  93.6  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  37.35 
 
 		 456 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  37.35 
 
 		 456 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  33.33 
 
 		 305 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  34.97 
 
 		 328 aa  93.2  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.52 
 
 		 313 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  28.67 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  30.27 
 
 		 417 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  33.94 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  34.36 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  27.98 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  24.17 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.26 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  33.94 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  35.43 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  31.19 
 
 		 424 aa  90.5  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  35.43 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.16 
 
 		 431 aa  89.7  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  34.16 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  26.07 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  28.08 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.5 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  36.26 
 
 		 443 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  31.79 
 
 		 313 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  26 
 
 		 491 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  26.1 
 
 		 447 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  34.55 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  36.31 
 
 		 337 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  30.52 
 
 		 409 aa  86.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  24.76 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  34.5 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  24.54 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  34.1 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  31.46 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  24.62 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.73 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  33.15 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.33 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  32.75 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  33.92 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  24.32 
 
 		 465 aa  82.8  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  31.95 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4756  DNA-cytosine methyltransferase  34.64 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  25.29 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  31.58 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  32.16 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  25.24 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  31.71 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>