More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1937 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1937  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 529 aa  1055    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.034289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2711  cytochrome c oxidase, subunit I  30.14 
 
 		 484 aa  150  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2970  cytochrome c oxidase, subunit I  29.03 
 
 		 499 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000172256  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0187  cytochrome c oxidase subunit I  28.6 
 
 		 483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2666  cytochrome c oxidase, subunit I  28.67 
 
 		 495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000219403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  26.57 
 
 		 540 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  27.45 
 
 		 527 aa  124  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  27.12 
 
 		 530 aa  123  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  25.78 
 
 		 555 aa  123  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  26.38 
 
 		 534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  27.6 
 
 		 529 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  26.42 
 
 		 536 aa  121  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  27.41 
 
 		 529 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  26.46 
 
 		 565 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  27.41 
 
 		 529 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  24.9 
 
 		 548 aa  120  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  27.31 
 
 		 546 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  26.57 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  27.03 
 
 		 529 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  26.53 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  27.15 
 
 		 555 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  26.35 
 
 		 536 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  26.4 
 
 		 530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  26.59 
 
 		 530 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  26.89 
 
 		 531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2475  cytochrome c oxidase, subunit I  24.95 
 
 		 591 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  25.05 
 
 		 543 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  26.46 
 
 		 559 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  26.17 
 
 		 530 aa  117  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  26.97 
 
 		 530 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0311  cytochrome c oxidase, subunit I  28.02 
 
 		 535 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  26.17 
 
 		 530 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  25.47 
 
 		 547 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  26.6 
 
 		 527 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  27.31 
 
 		 539 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1707  Cytochrome-c oxidase  26.14 
 
 		 649 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  27.15 
 
 		 541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  26.17 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  25.98 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  26.17 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  26.17 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  26.17 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0241  cytochrome-c oxidase  27.61 
 
 		 669 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  25.28 
 
 		 556 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2267  cytochrome c oxidase, subunit I  25.77 
 
 		 589 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  27.61 
 
 		 598 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  25.52 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  25.38 
 
 		 535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  25.94 
 
 		 530 aa  114  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  26.52 
 
 		 543 aa  114  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  25.44 
 
 		 586 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  25.44 
 
 		 586 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  25.87 
 
 		 534 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  26.68 
 
 		 572 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2593  cytochrome c oxidase, subunit I  25.48 
 
 		 592 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  25.83 
 
 		 532 aa  113  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0782  Cytochrome-c oxidase  26.91 
 
 		 716 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000788567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  24.84 
 
 		 542 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  26.93 
 
 		 564 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0632  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  26.91 
 
 		 705 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.714863  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  25.73 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  26.48 
 
 		 588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  26.01 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  25.77 
 
 		 531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  25.28 
 
 		 543 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  26.38 
 
 		 594 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  24.32 
 
 		 592 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  25.42 
 
 		 539 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2776  cytochrome-c oxidase  27.08 
 
 		 646 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842999  normal  0.700604 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  26.13 
 
 		 541 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  25.36 
 
 		 519 aa  110  5e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3535  cytochrome c oxidase, subunit I  26.22 
 
 		 676 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  27.12 
 
 		 537 aa  110  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  24.7 
 
 		 559 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  27.42 
 
 		 609 aa  110  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  26.39 
 
 		 541 aa  110  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  25.88 
 
 		 544 aa  110  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  25.38 
 
 		 532 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01280  Cytochrome-c oxidase  26.65 
 
 		 608 aa  110  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0596  cytochrome-c oxidase  27.17 
 
 		 669 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2031  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  27.61 
 
 		 669 aa  110  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0504466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4047  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  26.67 
 
 		 670 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.354742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  25.65 
 
 		 544 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  26.32 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  26.4 
 
 		 594 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  25.75 
 
 		 526 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  30.57 
 
 		 584 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  25.29 
 
 		 589 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  25.24 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  26.25 
 
 		 588 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  26.18 
 
 		 541 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2266  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  26.61 
 
 		 668 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4058  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  27.04 
 
 		 645 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.197273  normal  0.152019 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  26.21 
 
 		 539 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  26.18 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  27.75 
 
 		 589 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  31.01 
 
 		 563 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  26.72 
 
 		 541 aa  108  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  25.93 
 
 		 588 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  26.37 
 
 		 558 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>