More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1297 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 		 266 aa  535  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  46.84 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  45.11 
 
 		 265 aa  221  7e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  50.95 
 
 		 264 aa  221  9e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  45.86 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.82 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.18 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  35.32 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.57 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.2 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.82 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  31.07 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.69 
 
 		 282 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  33.74 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  31.02 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.62 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.45 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  31.31 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.92 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  31.46 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.7 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  31.78 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  35.91 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.58 
 
 		 324 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.53 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.41 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.53 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.91 
 
 		 281 aa  95.5  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  29.82 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  29.82 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  29.82 
 
 		 301 aa  93.6  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  31.13 
 
 		 301 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.27 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.06 
 
 		 296 aa  92  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  29.25 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  29.25 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.97 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  29.45 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.96 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  28.01 
 
 		 300 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.53 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.06 
 
 		 294 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.49 
 
 		 302 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.53 
 
 		 285 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  30.18 
 
 		 301 aa  89.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  28.01 
 
 		 300 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.01 
 
 		 300 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  28.01 
 
 		 300 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  28.01 
 
 		 300 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  28.01 
 
 		 300 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  28.7 
 
 		 456 aa  89.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  28.01 
 
 		 300 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  28.01 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  28.01 
 
 		 300 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  30.14 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.14 
 
 		 305 aa  89  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.82 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  30.37 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  29.82 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  28.25 
 
 		 459 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  29.82 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  29.82 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  32.99 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  32.99 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  28.77 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.97 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  31.12 
 
 		 293 aa  85.9  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  29.72 
 
 		 299 aa  85.5  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  30.65 
 
 		 301 aa  85.1  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  30.19 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.68 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.3 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  28.91 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  30.33 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  38.46 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  30.05 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.44 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  28.92 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  30.33 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.02 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  38.79 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  29.84 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.08 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.31 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  38.79 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  29.21 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  32.64 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.62 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  29.32 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  29.2 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  29.2 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  27.59 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  29.2 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.24 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  29.2 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  27.11 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.71 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  29.25 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.25 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>