More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0546 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 325 aa  654    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.22 
 
 		 312 aa  335  7e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.28 
 
 		 311 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.23 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.52 
 
 		 315 aa  329  4e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.27 
 
 		 308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 311 aa  309  4e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.56 
 
 		 317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.24 
 
 		 301 aa  298  8e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.54 
 
 		 319 aa  278  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.3 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  48.06 
 
 		 308 aa  277  1e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.81 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.3 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.45 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0958657  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.93 
 
 		 310 aa  263  4e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.75 
 
 		 306 aa  260  3e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.86 
 
 		 319 aa  256  5e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.55 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.04 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.77 
 
 		 313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  43.13 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.69 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.17 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.15 
 
 		 331 aa  209  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1334  UDP-glucose 4-epimerase  39.17 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.297801  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.68 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  35.24 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 324 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 		 303 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.84 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.02 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.15 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  32.44 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  31.85 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.88 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.51 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  31.03 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.63 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  35.38 
 
 		 331 aa  145  9e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.52 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13665  UDP-glucose 4-epimerase galE1  34.15 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0159869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0739  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.31 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.92 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 		 593 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.4 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.8 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 		 324 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>