92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0513 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 
249 aa  481  1e-135  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.49 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.77 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.27 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.81 
 
 
250 aa  72  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.58 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.45 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.22 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.74 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  32.38 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.06 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.32 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  28.46 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  28.46 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.46 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  28.46 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  28.46 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  28.46 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  28.46 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  28.46 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.8 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.8 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.35 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  34 
 
 
247 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  25 
 
 
254 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.05 
 
 
253 aa  62  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.36 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  27.67 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.81 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.67 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.56 
 
 
227 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.31 
 
 
249 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.4 
 
 
251 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  27.27 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.1 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  27.27 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  27.67 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.12 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.43 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  27.2 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.73 
 
 
240 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  26.58 
 
 
259 aa  52  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.39 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.3 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.26 
 
 
254 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  25.99 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.63 
 
 
253 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.06 
 
 
253 aa  49.3  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.24 
 
 
248 aa  48.9  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.44 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.92 
 
 
272 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  27.59 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.98 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.96 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.31 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.72 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  26.41 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.21 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.43 
 
 
261 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.59 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  26.72 
 
 
258 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  25.94 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.67 
 
 
277 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  26.29 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  26.29 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.7 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.77 
 
 
282 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.76 
 
 
241 aa  45.4  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.9 
 
 
251 aa  45.4  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.16 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  24.38 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.16 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.64 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  30 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.48 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  31.18 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.7 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1392  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.63 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5376  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.28 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  22.5 
 
 
302 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.51 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  31.43 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3406  hypothetical protein  39.68 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.286076  normal  0.20657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.88 
 
 
248 aa  42.4  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.27 
 
 
258 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  26.87 
 
 
258 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  31.19 
 
 
259 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  33.02 
 
 
258 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  27.31 
 
 
249 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  25.1 
 
 
248 aa  42  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2704  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.77 
 
 
262 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>