More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0084 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0084  major facilitator transporter  100 
 
 		 589 aa  1152    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0483176  normal  0.0703431 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 589 aa  427  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 		 573 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 560 aa  419  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2321  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 		 582 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1253  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 562 aa  409  1.0000000000000001e-112  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1280  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 562 aa  401  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1098  major facilitator superfamily MFS_1  42.29 
 
 		 591 aa  397  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.948323  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0518  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 		 567 aa  393  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2306  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 581 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.434674 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 582 aa  391  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 		 570 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 596 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3504  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 		 578 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 608 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3485  multidrug efflux protein  35.74 
 
 		 592 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.160972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1651  major facilitator transporter  38.87 
 
 		 641 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695517  normal  0.0730929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1554  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 610 aa  368  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0726  major facilitator superfamily transporter  36.67 
 
 		 576 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13994 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0555  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 587 aa  339  7e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0565  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 587 aa  339  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0577  major facilitator superfamily transporter  38.55 
 
 		 587 aa  339  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.410817  decreased coverage  0.00469629 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.87 
 
 		 482 aa  241  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.16 
 
 		 486 aa  236  9e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.11 
 
 		 487 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.26 
 
 		 456 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 477 aa  197  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 478 aa  193  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.8 
 
 		 471 aa  191  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.95 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 		 569 aa  182  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.33 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 477 aa  177  4e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  29.42 
 
 		 470 aa  177  7e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  31.01 
 
 		 462 aa  171  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.36 
 
 		 493 aa  171  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.74 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 465 aa  166  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  32.06 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.04 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.59 
 
 		 483 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.34 
 
 		 477 aa  160  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.36 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.42 
 
 		 522 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 		 474 aa  156  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.81 
 
 		 500 aa  156  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.68 
 
 		 534 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.71 
 
 		 477 aa  154  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 535 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 		 513 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 		 511 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 487 aa  151  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  28.57 
 
 		 508 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  27.96 
 
 		 513 aa  150  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  27.96 
 
 		 513 aa  150  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.96 
 
 		 513 aa  150  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 		 477 aa  150  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.96 
 
 		 513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.96 
 
 		 513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.63 
 
 		 511 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.12 
 
 		 513 aa  148  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.61 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.42 
 
 		 697 aa  148  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.56 
 
 		 513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.63 
 
 		 511 aa  147  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 513 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.65 
 
 		 535 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.85 
 
 		 475 aa  146  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  28.67 
 
 		 511 aa  146  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.18 
 
 		 478 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.44 
 
 		 513 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.85 
 
 		 493 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1354  putative export protein  31.93 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 		 641 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 539 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  29.19 
 
 		 492 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.63 
 
 		 592 aa  144  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.36 
 
 		 511 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  28.2 
 
 		 511 aa  144  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.14 
 
 		 538 aa  143  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.73 
 
 		 520 aa  143  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.63 
 
 		 511 aa  143  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  29.78 
 
 		 467 aa  143  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.44 
 
 		 515 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  32.29 
 
 		 465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.2 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.19 
 
 		 519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.53 
 
 		 538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.15 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 		 528 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  26.09 
 
 		 537 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  26.83 
 
 		 537 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.44 
 
 		 515 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>