More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1230 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1230  peptidase M50  100 
 
 
252 aa  494  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.704176  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1573  peptidase M50  81.75 
 
 
252 aa  418  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109375  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0005  peptidase M50  63.05 
 
 
250 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  37.98 
 
 
373 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.52 
 
 
374 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  37.9 
 
 
375 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.09 
 
 
385 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  45.76 
 
 
383 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.59 
 
 
343 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  44.92 
 
 
383 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  38.71 
 
 
367 aa  95.5  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  37.1 
 
 
377 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  43.22 
 
 
383 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  39.53 
 
 
419 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
463 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.33 
 
 
463 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.33 
 
 
463 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.33 
 
 
463 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
463 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.33 
 
 
463 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
463 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  38.76 
 
 
417 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2433  membrane-associated Zn-dependent protease 1  37.78 
 
 
428 aa  89.4  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  37.3 
 
 
383 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.56 
 
 
463 aa  89  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  37.21 
 
 
386 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.3 
 
 
361 aa  88.6  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.81 
 
 
462 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  32.81 
 
 
456 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  32.81 
 
 
462 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  37.88 
 
 
338 aa  87.8  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0574  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.01 
 
 
417 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30609  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0991  peptidase M50  29.15 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.22 
 
 
392 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.16 
 
 
357 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.89 
 
 
424 aa  87  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.98 
 
 
383 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  43.75 
 
 
450 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0544  hypothetical protein  43.75 
 
 
475 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.51 
 
 
455 aa  86.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  32.81 
 
 
462 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.48 
 
 
454 aa  86.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  32.03 
 
 
457 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  33.59 
 
 
461 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.03 
 
 
457 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.11 
 
 
335 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.11 
 
 
335 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.03 
 
 
457 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  33.59 
 
 
461 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.61 
 
 
355 aa  85.5  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  35.25 
 
 
448 aa  85.5  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.79 
 
 
383 aa  85.5  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0246  membrane-associated Zn-dependent protease 1  41.05 
 
 
420 aa  85.5  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  40.94 
 
 
450 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  36.72 
 
 
469 aa  84.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  32.03 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  40.71 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  40.17 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10880  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  32.2 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  41.86 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.95 
 
 
419 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0923796  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.93 
 
 
383 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.19 
 
 
455 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  32.81 
 
 
463 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.23 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  42.61 
 
 
347 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.01 
 
 
450 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  42.86 
 
 
417 aa  84  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  37.01 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  36.88 
 
 
494 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  34.62 
 
 
454 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.26 
 
 
495 aa  83.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.72 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.16 
 
 
452 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.16 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  38.76 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  27.15 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  40.83 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  36.51 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0829  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.21 
 
 
428 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0029507  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.66 
 
 
454 aa  82.4  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.58 
 
 
450 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.7 
 
 
456 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.07 
 
 
455 aa  82.4  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  37.69 
 
 
454 aa  82.4  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  37.7 
 
 
456 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  32.34 
 
 
456 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  44.09 
 
 
336 aa  82  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.34 
 
 
456 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.8 
 
 
453 aa  82  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  34.65 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  33.59 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.52 
 
 
456 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  41.38 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  36.51 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.52 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.52 
 
 
456 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.16 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  36.72 
 
 
461 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  35.16 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>