251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2608 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  100 
 
 
228 aa  431  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  52.08 
 
 
233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  54.76 
 
 
238 aa  168  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  52.27 
 
 
240 aa  168  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  40.98 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  40 
 
 
251 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  48.45 
 
 
209 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  41.58 
 
 
209 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  40.53 
 
 
242 aa  135  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  37.55 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  53.57 
 
 
238 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  33.87 
 
 
267 aa  121  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  39.77 
 
 
205 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  39.1 
 
 
200 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  39.1 
 
 
200 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  39.1 
 
 
200 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  39.64 
 
 
205 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  37.36 
 
 
215 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  34.97 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  36.67 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0744  SNARE associated Golgi protein  38.41 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  29.05 
 
 
256 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  28.1 
 
 
202 aa  62  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  35.56 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  35.59 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  30.32 
 
 
199 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  25 
 
 
214 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  28.21 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.81 
 
 
211 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2277  membrane-associated protein-like protein  30.81 
 
 
197 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  24.84 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  30.3 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  30.3 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0616  DedA family protein  31.18 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  32.86 
 
 
246 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  30.07 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  26.62 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  30.07 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  30.07 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  31.76 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  31.76 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  24.59 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  25.68 
 
 
199 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  27.27 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.78 
 
 
286 aa  55.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.87 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  30.12 
 
 
205 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  29.58 
 
 
363 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  34.07 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  30.5 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  27.27 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  31.18 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  25.55 
 
 
215 aa  53.1  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  32.35 
 
 
223 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  32.41 
 
 
681 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  30.51 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  31.58 
 
 
200 aa  52.4  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  31.55 
 
 
234 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0687  DedA family protein, putative  30.43 
 
 
212 aa  52  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00613405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  27.74 
 
 
214 aa  52  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3351  SNARE associated Golgi protein  29.81 
 
 
226 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194662  hitchhiker  0.00788727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  26.36 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  28.21 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.21 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  26.36 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  28.21 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  28.21 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  26.36 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  33.33 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  28.21 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  26.36 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1552  DedA family membrane protein  31.85 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.487737  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.11 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  28.9 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  25.32 
 
 
178 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  26.36 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  28.21 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  30.49 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  29.08 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  31.43 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.4 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  25 
 
 
197 aa  50.1  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  28.66 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  28.66 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0508  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.62 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  28.66 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  28.66 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  28.66 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  25.83 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 
200 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  30.99 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  28.75 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  25.64 
 
 
208 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  29.32 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  29.89 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  35.65 
 
 
677 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  29.49 
 
 
216 aa  49.3  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  30.99 
 
 
201 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  25.93 
 
 
207 aa  48.9  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>