More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1995 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  100 
 
 		 635 aa  1206    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  63.97 
 
 		 605 aa  682    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  68.47 
 
 		 606 aa  713    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  55.83 
 
 		 602 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  59.08 
 
 		 608 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  53.95 
 
 		 613 aa  536  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  51.7 
 
 		 589 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  54.86 
 
 		 608 aa  535  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  54.99 
 
 		 591 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  50.08 
 
 		 671 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  51.43 
 
 		 597 aa  514  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  51.96 
 
 		 610 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  48.04 
 
 		 726 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  49.32 
 
 		 584 aa  492  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.85 
 
 		 617 aa  485  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  50.5 
 
 		 625 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  47.85 
 
 		 609 aa  475  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  49 
 
 		 638 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  52.11 
 
 		 625 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.95 
 
 		 730 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  39.69 
 
 		 984 aa  283  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  35.77 
 
 		 659 aa  267  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  35.38 
 
 		 628 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  28.8 
 
 		 585 aa  266  8e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  35.38 
 
 		 640 aa  266  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.13 
 
 		 622 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  28.95 
 
 		 594 aa  263  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  29.7 
 
 		 593 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  30.59 
 
 		 589 aa  257  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.86 
 
 		 614 aa  257  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  34.76 
 
 		 663 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  34.91 
 
 		 654 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.16 
 
 		 577 aa  253  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  36.26 
 
 		 631 aa  252  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  29.93 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  34.34 
 
 		 581 aa  248  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  29.17 
 
 		 593 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  35.02 
 
 		 577 aa  248  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.55 
 
 		 627 aa  247  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.3 
 
 		 585 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  33.55 
 
 		 626 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  36.44 
 
 		 1522 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  30.76 
 
 		 579 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  34.98 
 
 		 658 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  28.9 
 
 		 586 aa  243  7.999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  29.39 
 
 		 596 aa  243  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  32.24 
 
 		 589 aa  243  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  30.26 
 
 		 591 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.59 
 
 		 575 aa  242  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  33.09 
 
 		 583 aa  242  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  33.33 
 
 		 584 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  27.39 
 
 		 606 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  34.87 
 
 		 600 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  29.78 
 
 		 577 aa  241  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.63 
 
 		 578 aa  240  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.63 
 
 		 578 aa  240  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  33.52 
 
 		 611 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  36.4 
 
 		 1301 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.73 
 
 		 586 aa  239  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  26.18 
 
 		 581 aa  239  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  33.17 
 
 		 636 aa  239  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.77 
 
 		 627 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  33.89 
 
 		 626 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  33.68 
 
 		 672 aa  239  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.61 
 
 		 608 aa  239  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.59 
 
 		 555 aa  238  3e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.94 
 
 		 579 aa  238  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  35.18 
 
 		 601 aa  237  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  33.72 
 
 		 627 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  33.72 
 
 		 627 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.54 
 
 		 600 aa  236  7e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  27.81 
 
 		 589 aa  236  7e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  32.13 
 
 		 577 aa  236  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  35.28 
 
 		 632 aa  236  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  34.47 
 
 		 641 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  36.12 
 
 		 642 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  30.83 
 
 		 768 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  34.4 
 
 		 650 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  34.4 
 
 		 650 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  30.18 
 
 		 572 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  28.43 
 
 		 607 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2670  ABC transporter related  30.07 
 
 		 622 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292907  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  34.1 
 
 		 648 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  26.98 
 
 		 581 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.15 
 
 		 589 aa  234  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  37.56 
 
 		 578 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  34.81 
 
 		 633 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  29.34 
 
 		 586 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.76 
 
 		 579 aa  234  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  29.49 
 
 		 586 aa  234  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  29.4 
 
 		 586 aa  233  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  30.74 
 
 		 572 aa  233  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  35.63 
 
 		 582 aa  233  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  28.23 
 
 		 571 aa  233  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.79 
 
 		 606 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.24 
 
 		 578 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.21 
 
 		 586 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.51 
 
 		 590 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  26.4 
 
 		 580 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>