More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1986 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2686  ABC transporter related  66.6 
 
 		 516 aa  685    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  100 
 
 		 511 aa  1024    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2519  ABC transporter related protein  60.8 
 
 		 515 aa  635    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  61.54 
 
 		 512 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2514  ABC transporter related protein  61.1 
 
 		 518 aa  636    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3199  ABC transporter-related protein  61.66 
 
 		 507 aa  634    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.28101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3660  ABC transporter related  67 
 
 		 512 aa  692    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4474  ABC transporter related  61.93 
 
 		 511 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  61.74 
 
 		 512 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0503  ABC transporter related  58.61 
 
 		 508 aa  631  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.689531  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  60.71 
 
 		 515 aa  634  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  59.8 
 
 		 508 aa  633  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  60.94 
 
 		 512 aa  633  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1181  ABC transporter related  62.1 
 
 		 520 aa  629  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000288216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2945  ABC transporter related  61.07 
 
 		 541 aa  629  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1104  ABC transporter related  61.61 
 
 		 519 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296869  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27960  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  59.69 
 
 		 512 aa  626  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4718  ABC transporter related  58.93 
 
 		 564 aa  626  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  60.75 
 
 		 521 aa  621  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  59.33 
 
 		 511 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3905  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  60.8 
 
 		 504 aa  621  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.876803  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  59.57 
 
 		 512 aa  619  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2253  ABC transporter-related protein  59.21 
 
 		 505 aa  618  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000512006 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1586  ABC transporter related  61.89 
 
 		 513 aa  615  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192443  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2890  ABC transporter related protein  60.16 
 
 		 516 aa  616  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0580102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2997  ABC transporter related  58.04 
 
 		 519 aa  616  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.746869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0405  ABC transporter related protein  57.39 
 
 		 514 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251912  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3073  ABC transporter related  58.37 
 
 		 511 aa  607  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.697432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  59.76 
 
 		 507 aa  599  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0738  ABC transporter related  57.54 
 
 		 505 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0384  ABC transporter related  57.76 
 
 		 509 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29470  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 513 aa  595  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1667  ABC transporter related  58.57 
 
 		 507 aa  591  1e-167  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.2144  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0936  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.45 
 
 		 529 aa  585  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.411664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3402  ABC transporter related protein  56.6 
 
 		 522 aa  587  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2746  ABC transporter related  55.8 
 
 		 524 aa  588  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0878  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.45 
 
 		 529 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  58.05 
 
 		 530 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2138  L-arabinose transport ATP-binding protein araG  57.06 
 
 		 516 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0757  ABC transporter related protein  54.03 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0933075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  57.97 
 
 		 504 aa  565  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1860  xylose ABC transporter ATPase  54.47 
 
 		 517 aa  555  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.05268  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0257  ABC transporter related protein  55.49 
 
 		 516 aa  548  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.391608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  53.6 
 
 		 505 aa  534  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  52.68 
 
 		 507 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0227  ABC transporter related  53.28 
 
 		 507 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  48.44 
 
 		 525 aa  484  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  49.11 
 
 		 509 aa  478  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  49.9 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 511 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4153  xylose transporter ATP-binding subunit  45.13 
 
 		 513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4435  xylose transporter ATP-binding subunit  45.24 
 
 		 513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1151  xylose transporter ATP-binding subunit  44.91 
 
 		 511 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  45.08 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0143  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  45.47 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  45.47 
 
 		 513 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  45.47 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 		 517 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  44.88 
 
 		 510 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0147  xylose transporter ATP-binding subunit  45.47 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  44.88 
 
 		 510 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4063  xylose transporter ATP-binding subunit  45.47 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3770  xylose transporter ATP-binding subunit  45.47 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  45.87 
 
 		 515 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  44.75 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  45.87 
 
 		 500 aa  435  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  45.87 
 
 		 515 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3955  xylose transporter ATP-binding subunit  45.28 
 
 		 513 aa  438  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0585  xylose transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 		 504 aa  435  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  46 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  43.27 
 
 		 513 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  45.73 
 
 		 501 aa  435  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  46.12 
 
 		 501 aa  433  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  45.58 
 
 		 501 aa  433  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  45.92 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1634  xylose transporter ATP-binding subunit  45.04 
 
 		 514 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  45.71 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0100  xylose transporter ATP-binding subunit  45.17 
 
 		 513 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0062  xylose transporter ATP-binding subunit  44.36 
 
 		 513 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0080  xylose transporter ATP-binding subunit  42.89 
 
 		 513 aa  432  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4075  xylose transporter ATP-binding subunit  45.01 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.818661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  42.88 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4187  xylose transporter ATP-binding subunit  45.01 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.300713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  44.2 
 
 		 525 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  43.64 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0775  xylose transporter ATP-binding subunit  45.73 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  46.05 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  44.91 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.02 
 
 		 512 aa  425  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.64 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  44.8 
 
 		 501 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  44.16 
 
 		 503 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  46.4 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  45.6 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  47.21 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  43.08 
 
 		 513 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  42.05 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  46.03 
 
 		 504 aa  422  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  43.34 
 
 		 524 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>