More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1872 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  64.44 
 
 		 243 aa  333  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  61.67 
 
 		 245 aa  325  5e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  61.83 
 
 		 241 aa  323  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  56.41 
 
 		 237 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  52.7 
 
 		 246 aa  268  7e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  59.29 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  55.31 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  41.67 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  45.68 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  44.26 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  44.26 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  41.32 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  41.32 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  42.22 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  40.83 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  42.22 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  40.08 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  37.8 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  40.08 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  41.03 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  41.53 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  40.16 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  38.75 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  39.67 
 
 		 242 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  39.67 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  40.49 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  38.31 
 
 		 251 aa  168  6e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  37.5 
 
 		 252 aa  168  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  39.67 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  39.67 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  41.03 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  40.16 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  38.87 
 
 		 254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  41.41 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  39.13 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  40 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  37.5 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  37.45 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  38.15 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  38.72 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  40.16 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  39.34 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  38.27 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  36.67 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  38.78 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  39.72 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  38.4 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  42.06 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  39.75 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  37.45 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  37.15 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0208  NAD-dependent deacetylase  40.38 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  34.87 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  37.45 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  38.71 
 
 		 245 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  37.45 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  37.61 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  37.2 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  38.31 
 
 		 243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  39.57 
 
 		 234 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  40.51 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  36.63 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  35.98 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  39.32 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  36.86 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  34.96 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  36.1 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  34.41 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  35.78 
 
 		 233 aa  141  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  34.02 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  38.15 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 251 aa  138  7.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  36.97 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  38.59 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  35.39 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1797  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  42.79 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  36.24 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  33.99 
 
 		 273 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  39.35 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  36.29 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0091  NAD-dependent deacetylase  35.78 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0206655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  34.3 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  35.59 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  35.63 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  34.85 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  34.47 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  34.7 
 
 		 275 aa  131  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  37.27 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  35.44 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  33.83 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  35 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  34.32 
 
 		 284 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  37.1 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  31.78 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  36.36 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  38.39 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  34.02 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>