188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5336 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5336  parB-like partition protein  100 
 
 		 343 aa  697    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.557995 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  47.75 
 
 		 321 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3917  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4954  parB-like partition protein  40.99 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4951  hypothetical protein  44.71 
 
 		 254 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  40.47 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3503  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.576785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  32.76 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  29.47 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  29.35 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  29.35 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  35.88 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  27.84 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  28.57 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  29 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  29 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  25.86 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  27.23 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  29.35 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  27.32 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  30.9 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  29.63 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  30.9 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  31.64 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  28.06 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  32.33 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  30.32 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  28.86 
 
 		 284 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  31.75 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  29.53 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  30.77 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  28.12 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  25.4 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  28.42 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07050  hypothetical protein  28.85 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  31.75 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  31.05 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  29.41 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  31.94 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  29.35 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  29.52 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  28.72 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  28.89 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000994  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB  27.37 
 
 		 324 aa  52.8  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  30.82 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  29.3 
 
 		 668 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  30.13 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  32.5 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  27.59 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  29.52 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1104  putative plasmid partition protein  28.85 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  29.57 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  29.79 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  32.37 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  28.42 
 
 		 296 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  30.19 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  28.23 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  26.05 
 
 		 290 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  30.82 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  26.83 
 
 		 294 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  26.05 
 
 		 290 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  28.8 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 281 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  30.16 
 
 		 303 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  30.07 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  28.8 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  28.38 
 
 		 292 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0131  ParB family protein  26.82 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  29.05 
 
 		 281 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  28.88 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  26.92 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  29.86 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  28.65 
 
 		 294 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  28.88 
 
 		 301 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  25.63 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  25.63 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  25.63 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  25.63 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  25.27 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  28.25 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  27.59 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  25.63 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  29.35 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  29.7 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  27.32 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  27.59 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  25.96 
 
 		 306 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  25.63 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  27.27 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  29.59 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  30.7 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  27.59 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  29.59 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  27.59 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  27.09 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  28.36 
 
 		 293 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  26.74 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>